Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIP4Q15650 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIP4Q15650 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIP4Q15650 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIP4Q15650 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIP4Q15650 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIP4Q15650 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIP4Q15650 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIP4Q15650 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIP4Q15650 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIP4Q15650 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIP4Q15650 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIP4Q15650 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIP4Q15650 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIP4Q15650 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIP4Q15650 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIP4Q15650 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIP4Q15650 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIP4Q15650 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIP4Q15650 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIP4Q15650 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIP4Q15650 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIP4Q15650 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIP4Q15650 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIP4Q15650 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIP4Q15650 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIP4Q15650 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIP4Q15650 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIP4Q15650 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIP4Q15650 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIP4Q15650 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIP4Q15650 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIP4Q15650 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIP4Q15650 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIP4Q15650 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIP4Q15650 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIP4Q15650 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIP4Q15650 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIP4Q15650 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIP4Q15650 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIP4Q15650 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIP4Q15650 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIP4Q15650 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIP4Q15650 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIP4Q15650 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIP4Q15650 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIP4Q15650 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIP4Q15650 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIP4Q15650 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIP4Q15650 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIP4Q15650 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIP4Q15650 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIP4Q15650 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIP4Q15650 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIP4Q15650 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIP4Q15650 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIP4Q15650 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIP4Q15650 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIP4Q15650 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIP4Q15650 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIP4Q15650 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIP4Q15650 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIP4Q15650 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIP4Q15650 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIP4Q15650 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIP4Q15650 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIP4Q15650 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIP4Q15650 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIP4Q15650 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIP4Q15650 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIP4Q15650 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIP4Q15650 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIP4Q15650 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIP4Q15650 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIP4Q15650 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIP4Q15650 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIP4Q15650 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIP4Q15650 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIP4Q15650 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIP4Q15650 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIP4Q15650 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIP4Q15650 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIP4Q15650 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIP4Q15650 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIP4Q15650 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIP4Q15650 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIP4Q15650 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIP4Q15650 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIP4Q15650 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIP4Q15650 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIP4Q15650 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIP4Q15650 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIP4Q15650 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIP4Q15650 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIP4Q15650 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIP4Q15650 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIP4Q15650 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIP4Q15650 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIP4Q15650 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIP4Q15650 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms