Protein–RNA interactions for Protein: Q15629

TRAM1, Translocating chain-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM1Q15629 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAM1Q15629 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAM1Q15629 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAM1Q15629 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAM1Q15629 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAM1Q15629 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAM1Q15629 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAM1Q15629 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAM1Q15629 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAM1Q15629 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAM1Q15629 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAM1Q15629 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAM1Q15629 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TRAM1Q15629 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAM1Q15629 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAM1Q15629 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAM1Q15629 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAM1Q15629 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAM1Q15629 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAM1Q15629 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAM1Q15629 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAM1Q15629 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAM1Q15629 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAM1Q15629 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAM1Q15629 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAM1Q15629 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAM1Q15629 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAM1Q15629 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAM1Q15629 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAM1Q15629 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAM1Q15629 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAM1Q15629 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAM1Q15629 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAM1Q15629 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAM1Q15629 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAM1Q15629 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAM1Q15629 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAM1Q15629 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAM1Q15629 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAM1Q15629 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAM1Q15629 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAM1Q15629 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAM1Q15629 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAM1Q15629 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAM1Q15629 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAM1Q15629 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAM1Q15629 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAM1Q15629 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAM1Q15629 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAM1Q15629 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAM1Q15629 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAM1Q15629 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAM1Q15629 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAM1Q15629 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAM1Q15629 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAM1Q15629 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAM1Q15629 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAM1Q15629 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAM1Q15629 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAM1Q15629 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAM1Q15629 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAM1Q15629 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAM1Q15629 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAM1Q15629 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAM1Q15629 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAM1Q15629 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAM1Q15629 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAM1Q15629 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAM1Q15629 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAM1Q15629 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAM1Q15629 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAM1Q15629 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAM1Q15629 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAM1Q15629 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAM1Q15629 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAM1Q15629 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAM1Q15629 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAM1Q15629 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAM1Q15629 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAM1Q15629 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAM1Q15629 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAM1Q15629 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAM1Q15629 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAM1Q15629 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAM1Q15629 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAM1Q15629 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAM1Q15629 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAM1Q15629 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAM1Q15629 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAM1Q15629 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAM1Q15629 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAM1Q15629 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAM1Q15629 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAM1Q15629 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAM1Q15629 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAM1Q15629 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAM1Q15629 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAM1Q15629 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAM1Q15629 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAM1Q15629 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms