Protein–RNA interactions for Protein: Q15599

SLC9A3R2, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF2, humanhuman

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Length 337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3R2Q15599 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC9A3R2Q15599 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC9A3R2Q15599 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC9A3R2Q15599 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC9A3R2Q15599 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC9A3R2Q15599 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC9A3R2Q15599 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC9A3R2Q15599 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC9A3R2Q15599 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC9A3R2Q15599 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC9A3R2Q15599 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC9A3R2Q15599 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC9A3R2Q15599 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC9A3R2Q15599 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC9A3R2Q15599 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC9A3R2Q15599 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC9A3R2Q15599 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC9A3R2Q15599 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC9A3R2Q15599 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC9A3R2Q15599 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC9A3R2Q15599 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC9A3R2Q15599 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC9A3R2Q15599 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC9A3R2Q15599 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC9A3R2Q15599 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC9A3R2Q15599 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC9A3R2Q15599 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC9A3R2Q15599 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC9A3R2Q15599 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC9A3R2Q15599 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC9A3R2Q15599 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC9A3R2Q15599 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC9A3R2Q15599 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC9A3R2Q15599 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC9A3R2Q15599 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC9A3R2Q15599 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC9A3R2Q15599 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC9A3R2Q15599 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC9A3R2Q15599 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC9A3R2Q15599 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC9A3R2Q15599 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC9A3R2Q15599 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC9A3R2Q15599 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC9A3R2Q15599 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC9A3R2Q15599 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC9A3R2Q15599 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC9A3R2Q15599 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC9A3R2Q15599 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC9A3R2Q15599 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC9A3R2Q15599 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC9A3R2Q15599 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC9A3R2Q15599 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC9A3R2Q15599 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC9A3R2Q15599 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC9A3R2Q15599 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC9A3R2Q15599 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC9A3R2Q15599 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC9A3R2Q15599 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC9A3R2Q15599 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC9A3R2Q15599 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC9A3R2Q15599 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC9A3R2Q15599 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC9A3R2Q15599 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC9A3R2Q15599 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC9A3R2Q15599 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC9A3R2Q15599 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC9A3R2Q15599 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC9A3R2Q15599 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC9A3R2Q15599 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC9A3R2Q15599 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC9A3R2Q15599 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC9A3R2Q15599 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC9A3R2Q15599 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC9A3R2Q15599 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC9A3R2Q15599 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC9A3R2Q15599 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC9A3R2Q15599 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC9A3R2Q15599 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC9A3R2Q15599 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC9A3R2Q15599 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC9A3R2Q15599 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC9A3R2Q15599 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC9A3R2Q15599 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC9A3R2Q15599 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC9A3R2Q15599 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC9A3R2Q15599 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC9A3R2Q15599 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC9A3R2Q15599 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC9A3R2Q15599 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC9A3R2Q15599 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC9A3R2Q15599 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC9A3R2Q15599 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC9A3R2Q15599 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC9A3R2Q15599 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC9A3R2Q15599 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC9A3R2Q15599 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC9A3R2Q15599 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC9A3R2Q15599 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC9A3R2Q15599 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC9A3R2Q15599 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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