Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC23BQ15437 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC23BQ15437 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC23BQ15437 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC23BQ15437 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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SEC23BQ15437 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC23BQ15437 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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SEC23BQ15437 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC23BQ15437 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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SEC23BQ15437 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEC23BQ15437 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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SEC23BQ15437 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEC23BQ15437 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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SEC23BQ15437 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
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SEC23BQ15437 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEC23BQ15437 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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SEC23BQ15437 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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SEC23BQ15437 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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SEC23BQ15437 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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SEC23BQ15437 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
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SEC23BQ15437 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEC23BQ15437 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEC23BQ15437 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEC23BQ15437 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SEC23BQ15437 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEC23BQ15437 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEC23BQ15437 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
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