Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TTF1Q15361 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TTF1Q15361 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TTF1Q15361 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TTF1Q15361 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TTF1Q15361 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TTF1Q15361 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
TTF1Q15361 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TTF1Q15361 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TTF1Q15361 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TTF1Q15361 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TTF1Q15361 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TTF1Q15361 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TTF1Q15361 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TTF1Q15361 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TTF1Q15361 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TTF1Q15361 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TTF1Q15361 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TTF1Q15361 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TTF1Q15361 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TTF1Q15361 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TTF1Q15361 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TTF1Q15361 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TTF1Q15361 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TTF1Q15361 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TTF1Q15361 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TTF1Q15361 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TTF1Q15361 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TTF1Q15361 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TTF1Q15361 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TTF1Q15361 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TTF1Q15361 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TTF1Q15361 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TTF1Q15361 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TTF1Q15361 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TTF1Q15361 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TTF1Q15361 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TTF1Q15361 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TTF1Q15361 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TTF1Q15361 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
TTF1Q15361 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TTF1Q15361 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TTF1Q15361 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TTF1Q15361 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TTF1Q15361 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TTF1Q15361 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TTF1Q15361 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TTF1Q15361 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TTF1Q15361 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TTF1Q15361 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TTF1Q15361 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TTF1Q15361 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TTF1Q15361 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TTF1Q15361 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TTF1Q15361 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TTF1Q15361 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TTF1Q15361 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
TTF1Q15361 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TTF1Q15361 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TTF1Q15361 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TTF1Q15361 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TTF1Q15361 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTF1Q15361 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTF1Q15361 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTF1Q15361 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTF1Q15361 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTF1Q15361 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTF1Q15361 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTF1Q15361 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTF1Q15361 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTF1Q15361 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTF1Q15361 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTF1Q15361 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TTF1Q15361 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TTF1Q15361 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TTF1Q15361 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TTF1Q15361 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TTF1Q15361 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TTF1Q15361 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TTF1Q15361 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TTF1Q15361 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TTF1Q15361 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TTF1Q15361 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TTF1Q15361 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TTF1Q15361 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TTF1Q15361 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TTF1Q15361 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TTF1Q15361 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TTF1Q15361 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TTF1Q15361 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TTF1Q15361 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TTF1Q15361 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TTF1Q15361 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TTF1Q15361 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TTF1Q15361 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TTF1Q15361 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TTF1Q15361 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TTF1Q15361 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TTF1Q15361 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TTF1Q15361 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
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