Protein–RNA interactions for Protein: Q15323

KRT31, Keratin, type I cuticular Ha1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT31Q15323 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT31Q15323 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT31Q15323 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT31Q15323 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT31Q15323 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT31Q15323 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT31Q15323 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT31Q15323 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT31Q15323 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT31Q15323 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT31Q15323 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT31Q15323 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT31Q15323 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT31Q15323 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT31Q15323 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT31Q15323 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT31Q15323 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT31Q15323 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT31Q15323 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT31Q15323 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT31Q15323 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT31Q15323 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT31Q15323 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT31Q15323 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT31Q15323 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT31Q15323 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT31Q15323 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT31Q15323 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT31Q15323 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT31Q15323 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
KRT31Q15323 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
KRT31Q15323 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT31Q15323 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT31Q15323 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT31Q15323 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT31Q15323 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT31Q15323 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT31Q15323 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT31Q15323 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT31Q15323 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT31Q15323 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT31Q15323 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT31Q15323 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT31Q15323 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT31Q15323 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT31Q15323 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT31Q15323 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT31Q15323 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT31Q15323 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT31Q15323 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT31Q15323 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT31Q15323 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT31Q15323 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT31Q15323 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT31Q15323 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT31Q15323 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT31Q15323 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT31Q15323 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT31Q15323 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT31Q15323 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT31Q15323 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT31Q15323 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT31Q15323 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT31Q15323 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT31Q15323 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT31Q15323 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT31Q15323 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT31Q15323 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT31Q15323 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT31Q15323 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT31Q15323 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT31Q15323 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT31Q15323 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT31Q15323 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT31Q15323 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT31Q15323 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT31Q15323 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT31Q15323 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT31Q15323 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT31Q15323 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT31Q15323 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT31Q15323 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT31Q15323 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT31Q15323 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT31Q15323 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT31Q15323 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT31Q15323 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT31Q15323 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT31Q15323 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT31Q15323 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT31Q15323 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT31Q15323 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT31Q15323 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT31Q15323 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT31Q15323 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT31Q15323 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT31Q15323 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT31Q15323 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT31Q15323 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT31Q15323 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms