Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDCD1Q15116 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDCD1Q15116 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDCD1Q15116 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDCD1Q15116 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDCD1Q15116 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDCD1Q15116 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDCD1Q15116 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDCD1Q15116 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDCD1Q15116 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDCD1Q15116 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDCD1Q15116 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDCD1Q15116 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDCD1Q15116 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDCD1Q15116 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDCD1Q15116 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDCD1Q15116 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDCD1Q15116 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDCD1Q15116 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDCD1Q15116 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDCD1Q15116 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDCD1Q15116 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDCD1Q15116 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDCD1Q15116 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDCD1Q15116 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDCD1Q15116 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDCD1Q15116 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDCD1Q15116 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDCD1Q15116 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDCD1Q15116 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDCD1Q15116 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDCD1Q15116 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDCD1Q15116 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDCD1Q15116 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDCD1Q15116 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDCD1Q15116 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDCD1Q15116 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDCD1Q15116 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDCD1Q15116 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDCD1Q15116 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDCD1Q15116 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDCD1Q15116 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDCD1Q15116 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDCD1Q15116 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PDCD1Q15116 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PDCD1Q15116 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PDCD1Q15116 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDCD1Q15116 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDCD1Q15116 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDCD1Q15116 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDCD1Q15116 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDCD1Q15116 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDCD1Q15116 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDCD1Q15116 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDCD1Q15116 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDCD1Q15116 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDCD1Q15116 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PDCD1Q15116 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PDCD1Q15116 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PDCD1Q15116 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PDCD1Q15116 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PDCD1Q15116 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PDCD1Q15116 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDCD1Q15116 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDCD1Q15116 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDCD1Q15116 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDCD1Q15116 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PDCD1Q15116 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDCD1Q15116 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDCD1Q15116 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDCD1Q15116 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDCD1Q15116 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDCD1Q15116 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDCD1Q15116 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDCD1Q15116 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDCD1Q15116 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PDCD1Q15116 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDCD1Q15116 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDCD1Q15116 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDCD1Q15116 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDCD1Q15116 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDCD1Q15116 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDCD1Q15116 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDCD1Q15116 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDCD1Q15116 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDCD1Q15116 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDCD1Q15116 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDCD1Q15116 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDCD1Q15116 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDCD1Q15116 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDCD1Q15116 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDCD1Q15116 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDCD1Q15116 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PDCD1Q15116 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDCD1Q15116 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDCD1Q15116 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDCD1Q15116 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDCD1Q15116 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDCD1Q15116 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDCD1Q15116 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms