Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRD3Q15059 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRD3Q15059 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRD3Q15059 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRD3Q15059 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRD3Q15059 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRD3Q15059 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRD3Q15059 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRD3Q15059 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRD3Q15059 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRD3Q15059 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRD3Q15059 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRD3Q15059 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRD3Q15059 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRD3Q15059 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRD3Q15059 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRD3Q15059 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRD3Q15059 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRD3Q15059 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
BRD3Q15059 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRD3Q15059 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRD3Q15059 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRD3Q15059 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRD3Q15059 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
BRD3Q15059 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRD3Q15059 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRD3Q15059 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRD3Q15059 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRD3Q15059 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRD3Q15059 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRD3Q15059 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRD3Q15059 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRD3Q15059 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRD3Q15059 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
BRD3Q15059 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRD3Q15059 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
BRD3Q15059 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRD3Q15059 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRD3Q15059 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRD3Q15059 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRD3Q15059 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRD3Q15059 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRD3Q15059 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRD3Q15059 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
BRD3Q15059 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRD3Q15059 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRD3Q15059 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRD3Q15059 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRD3Q15059 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRD3Q15059 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRD3Q15059 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRD3Q15059 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRD3Q15059 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRD3Q15059 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRD3Q15059 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRD3Q15059 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRD3Q15059 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRD3Q15059 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRD3Q15059 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRD3Q15059 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRD3Q15059 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRD3Q15059 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRD3Q15059 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRD3Q15059 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRD3Q15059 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRD3Q15059 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRD3Q15059 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRD3Q15059 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRD3Q15059 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRD3Q15059 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRD3Q15059 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRD3Q15059 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRD3Q15059 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRD3Q15059 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRD3Q15059 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRD3Q15059 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRD3Q15059 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRD3Q15059 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRD3Q15059 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRD3Q15059 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRD3Q15059 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRD3Q15059 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRD3Q15059 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRD3Q15059 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRD3Q15059 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRD3Q15059 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRD3Q15059 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRD3Q15059 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRD3Q15059 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRD3Q15059 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRD3Q15059 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRD3Q15059 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRD3Q15059 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRD3Q15059 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRD3Q15059 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRD3Q15059 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRD3Q15059 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRD3Q15059 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRD3Q15059 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRD3Q15059 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
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