Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAM2Q15035 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAM2Q15035 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAM2Q15035 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAM2Q15035 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAM2Q15035 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAM2Q15035 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAM2Q15035 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAM2Q15035 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAM2Q15035 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAM2Q15035 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAM2Q15035 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAM2Q15035 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAM2Q15035 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAM2Q15035 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAM2Q15035 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAM2Q15035 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAM2Q15035 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAM2Q15035 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAM2Q15035 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAM2Q15035 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAM2Q15035 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAM2Q15035 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAM2Q15035 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAM2Q15035 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAM2Q15035 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAM2Q15035 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAM2Q15035 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRAM2Q15035 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TRAM2Q15035 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRAM2Q15035 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
TRAM2Q15035 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
TRAM2Q15035 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAM2Q15035 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAM2Q15035 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAM2Q15035 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAM2Q15035 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAM2Q15035 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAM2Q15035 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAM2Q15035 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAM2Q15035 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRAM2Q15035 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TRAM2Q15035 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAM2Q15035 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAM2Q15035 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAM2Q15035 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAM2Q15035 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAM2Q15035 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAM2Q15035 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAM2Q15035 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRAM2Q15035 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAM2Q15035 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAM2Q15035 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAM2Q15035 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAM2Q15035 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRAM2Q15035 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAM2Q15035 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAM2Q15035 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRAM2Q15035 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRAM2Q15035 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAM2Q15035 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAM2Q15035 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRAM2Q15035 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRAM2Q15035 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAM2Q15035 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAM2Q15035 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAM2Q15035 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAM2Q15035 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAM2Q15035 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAM2Q15035 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAM2Q15035 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAM2Q15035 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAM2Q15035 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAM2Q15035 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRAM2Q15035 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAM2Q15035 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAM2Q15035 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAM2Q15035 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRAM2Q15035 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAM2Q15035 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAM2Q15035 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAM2Q15035 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRAM2Q15035 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAM2Q15035 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAM2Q15035 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAM2Q15035 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAM2Q15035 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAM2Q15035 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAM2Q15035 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAM2Q15035 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAM2Q15035 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAM2Q15035 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAM2Q15035 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAM2Q15035 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAM2Q15035 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAM2Q15035 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAM2Q15035 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAM2Q15035 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAM2Q15035 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAM2Q15035 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
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