Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCAPHQ15003 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCAPHQ15003 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCAPHQ15003 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCAPHQ15003 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCAPHQ15003 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCAPHQ15003 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCAPHQ15003 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NCAPHQ15003 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NCAPHQ15003 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCAPHQ15003 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NCAPHQ15003 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NCAPHQ15003 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NCAPHQ15003 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NCAPHQ15003 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NCAPHQ15003 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NCAPHQ15003 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NCAPHQ15003 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NCAPHQ15003 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NCAPHQ15003 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NCAPHQ15003 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NCAPHQ15003 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCAPHQ15003 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCAPHQ15003 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCAPHQ15003 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCAPHQ15003 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCAPHQ15003 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCAPHQ15003 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NCAPHQ15003 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NCAPHQ15003 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NCAPHQ15003 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NCAPHQ15003 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NCAPHQ15003 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NCAPHQ15003 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NCAPHQ15003 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NCAPHQ15003 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NCAPHQ15003 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NCAPHQ15003 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NCAPHQ15003 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NCAPHQ15003 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NCAPHQ15003 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NCAPHQ15003 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NCAPHQ15003 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NCAPHQ15003 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NCAPHQ15003 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NCAPHQ15003 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NCAPHQ15003 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NCAPHQ15003 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NCAPHQ15003 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NCAPHQ15003 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NCAPHQ15003 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NCAPHQ15003 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NCAPHQ15003 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NCAPHQ15003 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NCAPHQ15003 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NCAPHQ15003 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NCAPHQ15003 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NCAPHQ15003 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NCAPHQ15003 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NCAPHQ15003 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NCAPHQ15003 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NCAPHQ15003 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NCAPHQ15003 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NCAPHQ15003 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NCAPHQ15003 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NCAPHQ15003 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NCAPHQ15003 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NCAPHQ15003 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NCAPHQ15003 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NCAPHQ15003 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NCAPHQ15003 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NCAPHQ15003 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NCAPHQ15003 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NCAPHQ15003 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NCAPHQ15003 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NCAPHQ15003 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NCAPHQ15003 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NCAPHQ15003 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCAPHQ15003 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCAPHQ15003 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCAPHQ15003 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NCAPHQ15003 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCAPHQ15003 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCAPHQ15003 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCAPHQ15003 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCAPHQ15003 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCAPHQ15003 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCAPHQ15003 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NCAPHQ15003 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCAPHQ15003 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
NCAPHQ15003 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCAPHQ15003 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCAPHQ15003 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCAPHQ15003 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCAPHQ15003 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCAPHQ15003 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCAPHQ15003 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCAPHQ15003 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCAPHQ15003 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCAPHQ15003 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
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