Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF1Q14990 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODF1Q14990 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODF1Q14990 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODF1Q14990 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ODF1Q14990 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ODF1Q14990 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ODF1Q14990 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF1Q14990 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF1Q14990 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF1Q14990 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF1Q14990 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF1Q14990 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF1Q14990 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF1Q14990 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF1Q14990 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF1Q14990 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF1Q14990 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ODF1Q14990 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF1Q14990 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF1Q14990 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF1Q14990 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF1Q14990 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF1Q14990 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF1Q14990 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF1Q14990 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF1Q14990 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF1Q14990 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ODF1Q14990 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF1Q14990 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF1Q14990 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF1Q14990 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF1Q14990 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF1Q14990 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF1Q14990 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF1Q14990 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF1Q14990 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF1Q14990 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF1Q14990 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF1Q14990 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF1Q14990 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF1Q14990 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF1Q14990 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF1Q14990 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF1Q14990 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF1Q14990 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF1Q14990 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF1Q14990 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ODF1Q14990 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODF1Q14990 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODF1Q14990 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODF1Q14990 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODF1Q14990 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODF1Q14990 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODF1Q14990 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODF1Q14990 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ODF1Q14990 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF1Q14990 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF1Q14990 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF1Q14990 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF1Q14990 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF1Q14990 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF1Q14990 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF1Q14990 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF1Q14990 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF1Q14990 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF1Q14990 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF1Q14990 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF1Q14990 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF1Q14990 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ODF1Q14990 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF1Q14990 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF1Q14990 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF1Q14990 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF1Q14990 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF1Q14990 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF1Q14990 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF1Q14990 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF1Q14990 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF1Q14990 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF1Q14990 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF1Q14990 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF1Q14990 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF1Q14990 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF1Q14990 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF1Q14990 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF1Q14990 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF1Q14990 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF1Q14990 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF1Q14990 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF1Q14990 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF1Q14990 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF1Q14990 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF1Q14990 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF1Q14990 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF1Q14990 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF1Q14990 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF1Q14990 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF1Q14990 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF1Q14990 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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