Protein–RNA interactions for Protein: Q14444

CAPRIN1, Caprin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN1Q14444 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPRIN1Q14444 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPRIN1Q14444 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPRIN1Q14444 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPRIN1Q14444 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPRIN1Q14444 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPRIN1Q14444 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPRIN1Q14444 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPRIN1Q14444 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPRIN1Q14444 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPRIN1Q14444 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPRIN1Q14444 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPRIN1Q14444 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPRIN1Q14444 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPRIN1Q14444 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPRIN1Q14444 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPRIN1Q14444 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPRIN1Q14444 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPRIN1Q14444 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPRIN1Q14444 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPRIN1Q14444 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPRIN1Q14444 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPRIN1Q14444 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPRIN1Q14444 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPRIN1Q14444 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPRIN1Q14444 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPRIN1Q14444 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPRIN1Q14444 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPRIN1Q14444 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPRIN1Q14444 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPRIN1Q14444 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPRIN1Q14444 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPRIN1Q14444 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPRIN1Q14444 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPRIN1Q14444 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPRIN1Q14444 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPRIN1Q14444 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPRIN1Q14444 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPRIN1Q14444 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPRIN1Q14444 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CAPRIN1Q14444 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPRIN1Q14444 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPRIN1Q14444 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPRIN1Q14444 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPRIN1Q14444 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPRIN1Q14444 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPRIN1Q14444 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPRIN1Q14444 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPRIN1Q14444 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPRIN1Q14444 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPRIN1Q14444 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPRIN1Q14444 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPRIN1Q14444 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPRIN1Q14444 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPRIN1Q14444 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPRIN1Q14444 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPRIN1Q14444 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPRIN1Q14444 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPRIN1Q14444 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPRIN1Q14444 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPRIN1Q14444 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPRIN1Q14444 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPRIN1Q14444 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPRIN1Q14444 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPRIN1Q14444 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPRIN1Q14444 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPRIN1Q14444 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPRIN1Q14444 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPRIN1Q14444 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPRIN1Q14444 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPRIN1Q14444 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPRIN1Q14444 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPRIN1Q14444 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPRIN1Q14444 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPRIN1Q14444 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPRIN1Q14444 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPRIN1Q14444 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPRIN1Q14444 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPRIN1Q14444 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPRIN1Q14444 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPRIN1Q14444 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPRIN1Q14444 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPRIN1Q14444 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPRIN1Q14444 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPRIN1Q14444 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPRIN1Q14444 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPRIN1Q14444 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPRIN1Q14444 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAPRIN1Q14444 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPRIN1Q14444 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPRIN1Q14444 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPRIN1Q14444 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPRIN1Q14444 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPRIN1Q14444 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPRIN1Q14444 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAPRIN1Q14444 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPRIN1Q14444 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPRIN1Q14444 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPRIN1Q14444 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPRIN1Q14444 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
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