Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EBI3Q14213 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EBI3Q14213 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EBI3Q14213 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
EBI3Q14213 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EBI3Q14213 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EBI3Q14213 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EBI3Q14213 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EBI3Q14213 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EBI3Q14213 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EBI3Q14213 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EBI3Q14213 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EBI3Q14213 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EBI3Q14213 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
EBI3Q14213 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
EBI3Q14213 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EBI3Q14213 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EBI3Q14213 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EBI3Q14213 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EBI3Q14213 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EBI3Q14213 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EBI3Q14213 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EBI3Q14213 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EBI3Q14213 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EBI3Q14213 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EBI3Q14213 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EBI3Q14213 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EBI3Q14213 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EBI3Q14213 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EBI3Q14213 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EBI3Q14213 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EBI3Q14213 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EBI3Q14213 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EBI3Q14213 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EBI3Q14213 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
EBI3Q14213 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EBI3Q14213 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EBI3Q14213 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EBI3Q14213 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EBI3Q14213 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EBI3Q14213 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EBI3Q14213 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EBI3Q14213 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EBI3Q14213 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EBI3Q14213 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EBI3Q14213 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EBI3Q14213 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EBI3Q14213 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EBI3Q14213 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EBI3Q14213 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EBI3Q14213 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EBI3Q14213 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EBI3Q14213 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EBI3Q14213 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EBI3Q14213 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EBI3Q14213 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EBI3Q14213 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EBI3Q14213 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EBI3Q14213 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EBI3Q14213 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EBI3Q14213 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EBI3Q14213 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EBI3Q14213 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EBI3Q14213 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EBI3Q14213 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EBI3Q14213 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EBI3Q14213 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EBI3Q14213 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
EBI3Q14213 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
EBI3Q14213 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EBI3Q14213 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
EBI3Q14213 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
EBI3Q14213 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EBI3Q14213 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
EBI3Q14213 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EBI3Q14213 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EBI3Q14213 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EBI3Q14213 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EBI3Q14213 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EBI3Q14213 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
EBI3Q14213 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EBI3Q14213 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EBI3Q14213 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EBI3Q14213 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EBI3Q14213 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EBI3Q14213 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EBI3Q14213 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EBI3Q14213 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EBI3Q14213 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EBI3Q14213 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EBI3Q14213 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EBI3Q14213 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EBI3Q14213 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EBI3Q14213 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EBI3Q14213 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EBI3Q14213 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EBI3Q14213 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EBI3Q14213 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
EBI3Q14213 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EBI3Q14213 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms