Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CBFBQ13951 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CBFBQ13951 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBFBQ13951 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBFBQ13951 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBFBQ13951 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CBFBQ13951 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBFBQ13951 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBFBQ13951 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBFBQ13951 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBFBQ13951 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBFBQ13951 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBFBQ13951 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBFBQ13951 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBFBQ13951 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBFBQ13951 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBFBQ13951 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBFBQ13951 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBFBQ13951 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CBFBQ13951 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBFBQ13951 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBFBQ13951 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBFBQ13951 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBFBQ13951 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBFBQ13951 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBFBQ13951 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBFBQ13951 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBFBQ13951 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CBFBQ13951 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBFBQ13951 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBFBQ13951 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBFBQ13951 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBFBQ13951 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CBFBQ13951 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CBFBQ13951 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CBFBQ13951 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBFBQ13951 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBFBQ13951 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBFBQ13951 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBFBQ13951 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBFBQ13951 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBFBQ13951 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBFBQ13951 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CBFBQ13951 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CBFBQ13951 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CBFBQ13951 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CBFBQ13951 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CBFBQ13951 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CBFBQ13951 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CBFBQ13951 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CBFBQ13951 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CBFBQ13951 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CBFBQ13951 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CBFBQ13951 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
CBFBQ13951 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CBFBQ13951 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CBFBQ13951 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CBFBQ13951 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CBFBQ13951 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CBFBQ13951 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CBFBQ13951 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CBFBQ13951 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CBFBQ13951 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CBFBQ13951 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CBFBQ13951 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CBFBQ13951 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CBFBQ13951 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CBFBQ13951 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CBFBQ13951 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CBFBQ13951 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CBFBQ13951 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CBFBQ13951 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CBFBQ13951 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CBFBQ13951 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CBFBQ13951 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CBFBQ13951 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CBFBQ13951 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CBFBQ13951 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CBFBQ13951 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CBFBQ13951 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CBFBQ13951 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CBFBQ13951 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CBFBQ13951 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CBFBQ13951 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CBFBQ13951 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CBFBQ13951 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CBFBQ13951 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CBFBQ13951 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CBFBQ13951 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CBFBQ13951 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CBFBQ13951 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CBFBQ13951 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
CBFBQ13951 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CBFBQ13951 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CBFBQ13951 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CBFBQ13951 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CBFBQ13951 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CBFBQ13951 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CBFBQ13951 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CBFBQ13951 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms