Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAPSQ13938 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAPSQ13938 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAPSQ13938 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAPSQ13938 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAPSQ13938 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAPSQ13938 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CAPSQ13938 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CAPSQ13938 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAPSQ13938 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAPSQ13938 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAPSQ13938 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAPSQ13938 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAPSQ13938 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAPSQ13938 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAPSQ13938 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAPSQ13938 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CAPSQ13938 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAPSQ13938 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAPSQ13938 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CAPSQ13938 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAPSQ13938 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAPSQ13938 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAPSQ13938 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAPSQ13938 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAPSQ13938 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAPSQ13938 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAPSQ13938 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAPSQ13938 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAPSQ13938 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAPSQ13938 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAPSQ13938 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAPSQ13938 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAPSQ13938 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CAPSQ13938 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAPSQ13938 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAPSQ13938 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAPSQ13938 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CAPSQ13938 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CAPSQ13938 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAPSQ13938 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAPSQ13938 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CAPSQ13938 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAPSQ13938 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAPSQ13938 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAPSQ13938 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAPSQ13938 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAPSQ13938 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAPSQ13938 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAPSQ13938 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CAPSQ13938 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAPSQ13938 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAPSQ13938 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAPSQ13938 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAPSQ13938 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CAPSQ13938 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAPSQ13938 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAPSQ13938 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAPSQ13938 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CAPSQ13938 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAPSQ13938 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAPSQ13938 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CAPSQ13938 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CAPSQ13938 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CAPSQ13938 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CAPSQ13938 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CAPSQ13938 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CAPSQ13938 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CAPSQ13938 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CAPSQ13938 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CAPSQ13938 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CAPSQ13938 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CAPSQ13938 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CAPSQ13938 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAPSQ13938 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAPSQ13938 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAPSQ13938 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAPSQ13938 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAPSQ13938 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAPSQ13938 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAPSQ13938 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAPSQ13938 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAPSQ13938 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAPSQ13938 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAPSQ13938 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAPSQ13938 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAPSQ13938 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAPSQ13938 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAPSQ13938 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CAPSQ13938 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAPSQ13938 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAPSQ13938 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAPSQ13938 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAPSQ13938 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CAPSQ13938 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAPSQ13938 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAPSQ13938 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAPSQ13938 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAPSQ13938 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAPSQ13938 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159.8 ms