Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PMS2P11Q13670 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PMS2P11Q13670 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PMS2P11Q13670 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PMS2P11Q13670 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PMS2P11Q13670 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PMS2P11Q13670 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PMS2P11Q13670 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PMS2P11Q13670 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PMS2P11Q13670 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PMS2P11Q13670 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PMS2P11Q13670 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PMS2P11Q13670 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PMS2P11Q13670 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PMS2P11Q13670 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PMS2P11Q13670 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PMS2P11Q13670 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PMS2P11Q13670 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PMS2P11Q13670 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PMS2P11Q13670 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PMS2P11Q13670 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PMS2P11Q13670 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PMS2P11Q13670 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PMS2P11Q13670 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PMS2P11Q13670 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PMS2P11Q13670 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PMS2P11Q13670 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PMS2P11Q13670 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PMS2P11Q13670 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PMS2P11Q13670 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PMS2P11Q13670 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PMS2P11Q13670 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PMS2P11Q13670 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PMS2P11Q13670 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PMS2P11Q13670 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PMS2P11Q13670 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PMS2P11Q13670 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PMS2P11Q13670 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PMS2P11Q13670 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PMS2P11Q13670 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PMS2P11Q13670 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PMS2P11Q13670 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PMS2P11Q13670 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PMS2P11Q13670 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PMS2P11Q13670 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PMS2P11Q13670 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PMS2P11Q13670 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PMS2P11Q13670 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PMS2P11Q13670 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PMS2P11Q13670 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PMS2P11Q13670 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PMS2P11Q13670 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PMS2P11Q13670 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PMS2P11Q13670 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PMS2P11Q13670 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PMS2P11Q13670 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PMS2P11Q13670 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PMS2P11Q13670 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PMS2P11Q13670 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PMS2P11Q13670 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PMS2P11Q13670 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PMS2P11Q13670 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PMS2P11Q13670 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PMS2P11Q13670 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PMS2P11Q13670 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PMS2P11Q13670 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PMS2P11Q13670 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PMS2P11Q13670 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PMS2P11Q13670 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PMS2P11Q13670 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PMS2P11Q13670 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PMS2P11Q13670 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PMS2P11Q13670 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PMS2P11Q13670 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PMS2P11Q13670 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PMS2P11Q13670 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PMS2P11Q13670 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PMS2P11Q13670 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PMS2P11Q13670 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PMS2P11Q13670 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PMS2P11Q13670 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PMS2P11Q13670 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PMS2P11Q13670 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PMS2P11Q13670 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PMS2P11Q13670 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PMS2P11Q13670 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PMS2P11Q13670 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PMS2P11Q13670 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PMS2P11Q13670 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PMS2P11Q13670 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PMS2P11Q13670 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PMS2P11Q13670 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PMS2P11Q13670 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PMS2P11Q13670 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PMS2P11Q13670 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PMS2P11Q13670 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PMS2P11Q13670 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PMS2P11Q13670 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PMS2P11Q13670 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PMS2P11Q13670 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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