Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNASE1L3Q13609 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNASE1L3Q13609 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
DNASE1L3Q13609 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
DNASE1L3Q13609 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DNASE1L3Q13609 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DNASE1L3Q13609 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNASE1L3Q13609 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNASE1L3Q13609 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DNASE1L3Q13609 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DNASE1L3Q13609 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNASE1L3Q13609 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNASE1L3Q13609 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNASE1L3Q13609 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNASE1L3Q13609 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNASE1L3Q13609 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNASE1L3Q13609 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNASE1L3Q13609 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNASE1L3Q13609 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNASE1L3Q13609 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNASE1L3Q13609 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNASE1L3Q13609 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNASE1L3Q13609 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNASE1L3Q13609 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNASE1L3Q13609 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNASE1L3Q13609 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNASE1L3Q13609 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DNASE1L3Q13609 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNASE1L3Q13609 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNASE1L3Q13609 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNASE1L3Q13609 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNASE1L3Q13609 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNASE1L3Q13609 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNASE1L3Q13609 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNASE1L3Q13609 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNASE1L3Q13609 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNASE1L3Q13609 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNASE1L3Q13609 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNASE1L3Q13609 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNASE1L3Q13609 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNASE1L3Q13609 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNASE1L3Q13609 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNASE1L3Q13609 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNASE1L3Q13609 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNASE1L3Q13609 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNASE1L3Q13609 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNASE1L3Q13609 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNASE1L3Q13609 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNASE1L3Q13609 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNASE1L3Q13609 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNASE1L3Q13609 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNASE1L3Q13609 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNASE1L3Q13609 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNASE1L3Q13609 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNASE1L3Q13609 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNASE1L3Q13609 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNASE1L3Q13609 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DNASE1L3Q13609 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNASE1L3Q13609 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNASE1L3Q13609 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DNASE1L3Q13609 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DNASE1L3Q13609 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DNASE1L3Q13609 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNASE1L3Q13609 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNASE1L3Q13609 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNASE1L3Q13609 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNASE1L3Q13609 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNASE1L3Q13609 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNASE1L3Q13609 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNASE1L3Q13609 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNASE1L3Q13609 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNASE1L3Q13609 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNASE1L3Q13609 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNASE1L3Q13609 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNASE1L3Q13609 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNASE1L3Q13609 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNASE1L3Q13609 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNASE1L3Q13609 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DNASE1L3Q13609 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DNASE1L3Q13609 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNASE1L3Q13609 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNASE1L3Q13609 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNASE1L3Q13609 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNASE1L3Q13609 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNASE1L3Q13609 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNASE1L3Q13609 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNASE1L3Q13609 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DNASE1L3Q13609 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNASE1L3Q13609 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNASE1L3Q13609 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNASE1L3Q13609 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNASE1L3Q13609 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNASE1L3Q13609 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNASE1L3Q13609 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNASE1L3Q13609 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNASE1L3Q13609 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNASE1L3Q13609 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNASE1L3Q13609 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNASE1L3Q13609 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNASE1L3Q13609 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms