Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXE3Q13461 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXE3Q13461 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FOXE3Q13461 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FOXE3Q13461 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FOXE3Q13461 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXE3Q13461 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXE3Q13461 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXE3Q13461 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXE3Q13461 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXE3Q13461 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXE3Q13461 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXE3Q13461 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXE3Q13461 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXE3Q13461 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXE3Q13461 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FOXE3Q13461 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXE3Q13461 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXE3Q13461 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXE3Q13461 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXE3Q13461 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXE3Q13461 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXE3Q13461 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXE3Q13461 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXE3Q13461 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FOXE3Q13461 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXE3Q13461 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXE3Q13461 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXE3Q13461 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXE3Q13461 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXE3Q13461 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXE3Q13461 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXE3Q13461 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXE3Q13461 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXE3Q13461 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXE3Q13461 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
FOXE3Q13461 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXE3Q13461 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXE3Q13461 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXE3Q13461 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXE3Q13461 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXE3Q13461 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXE3Q13461 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXE3Q13461 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXE3Q13461 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXE3Q13461 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXE3Q13461 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXE3Q13461 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXE3Q13461 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXE3Q13461 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXE3Q13461 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXE3Q13461 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXE3Q13461 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FOXE3Q13461 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXE3Q13461 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXE3Q13461 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXE3Q13461 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXE3Q13461 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXE3Q13461 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXE3Q13461 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXE3Q13461 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXE3Q13461 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXE3Q13461 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXE3Q13461 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXE3Q13461 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FOXE3Q13461 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXE3Q13461 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXE3Q13461 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXE3Q13461 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXE3Q13461 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXE3Q13461 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXE3Q13461 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXE3Q13461 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXE3Q13461 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXE3Q13461 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXE3Q13461 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FOXE3Q13461 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXE3Q13461 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXE3Q13461 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXE3Q13461 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXE3Q13461 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXE3Q13461 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FOXE3Q13461 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FOXE3Q13461 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FOXE3Q13461 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXE3Q13461 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXE3Q13461 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXE3Q13461 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXE3Q13461 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXE3Q13461 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXE3Q13461 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXE3Q13461 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXE3Q13461 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FOXE3Q13461 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXE3Q13461 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXE3Q13461 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXE3Q13461 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXE3Q13461 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXE3Q13461 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FOXE3Q13461 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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