Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATMQ13315 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATMQ13315 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ATMQ13315 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATMQ13315 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATMQ13315 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATMQ13315 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATMQ13315 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATMQ13315 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATMQ13315 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATMQ13315 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATMQ13315 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATMQ13315 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATMQ13315 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATMQ13315 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATMQ13315 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ATMQ13315 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATMQ13315 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATMQ13315 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATMQ13315 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATMQ13315 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATMQ13315 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATMQ13315 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATMQ13315 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATMQ13315 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATMQ13315 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATMQ13315 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATMQ13315 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATMQ13315 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATMQ13315 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATMQ13315 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATMQ13315 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATMQ13315 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATMQ13315 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATMQ13315 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATMQ13315 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ATMQ13315 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATMQ13315 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATMQ13315 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ATMQ13315 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATMQ13315 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATMQ13315 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATMQ13315 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ATMQ13315 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATMQ13315 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATMQ13315 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATMQ13315 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATMQ13315 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATMQ13315 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATMQ13315 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATMQ13315 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATMQ13315 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATMQ13315 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATMQ13315 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ATMQ13315 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATMQ13315 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATMQ13315 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATMQ13315 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATMQ13315 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATMQ13315 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATMQ13315 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ATMQ13315 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATMQ13315 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATMQ13315 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATMQ13315 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATMQ13315 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ATMQ13315 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATMQ13315 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATMQ13315 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATMQ13315 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATMQ13315 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATMQ13315 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATMQ13315 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATMQ13315 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATMQ13315 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ATMQ13315 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATMQ13315 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATMQ13315 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATMQ13315 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATMQ13315 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATMQ13315 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATMQ13315 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATMQ13315 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATMQ13315 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATMQ13315 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATMQ13315 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ATMQ13315 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATMQ13315 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATMQ13315 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATMQ13315 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATMQ13315 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ATMQ13315 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATMQ13315 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATMQ13315 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATMQ13315 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ATMQ13315 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
ATMQ13315 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATMQ13315 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATMQ13315 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATMQ13315 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
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