Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLN3Q13286 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLN3Q13286 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLN3Q13286 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CLN3Q13286 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLN3Q13286 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLN3Q13286 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLN3Q13286 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLN3Q13286 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLN3Q13286 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CLN3Q13286 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLN3Q13286 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLN3Q13286 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLN3Q13286 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLN3Q13286 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLN3Q13286 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLN3Q13286 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLN3Q13286 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CLN3Q13286 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLN3Q13286 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLN3Q13286 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CLN3Q13286 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLN3Q13286 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLN3Q13286 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLN3Q13286 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLN3Q13286 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLN3Q13286 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLN3Q13286 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLN3Q13286 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CLN3Q13286 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLN3Q13286 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CLN3Q13286 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLN3Q13286 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLN3Q13286 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLN3Q13286 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLN3Q13286 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLN3Q13286 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLN3Q13286 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CLN3Q13286 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLN3Q13286 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLN3Q13286 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLN3Q13286 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLN3Q13286 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLN3Q13286 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLN3Q13286 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLN3Q13286 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CLN3Q13286 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLN3Q13286 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLN3Q13286 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLN3Q13286 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLN3Q13286 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLN3Q13286 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLN3Q13286 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLN3Q13286 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLN3Q13286 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLN3Q13286 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLN3Q13286 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLN3Q13286 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLN3Q13286 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLN3Q13286 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLN3Q13286 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLN3Q13286 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CLN3Q13286 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CLN3Q13286 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLN3Q13286 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLN3Q13286 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLN3Q13286 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLN3Q13286 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLN3Q13286 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLN3Q13286 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLN3Q13286 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLN3Q13286 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLN3Q13286 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLN3Q13286 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLN3Q13286 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLN3Q13286 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CLN3Q13286 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CLN3Q13286 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLN3Q13286 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLN3Q13286 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLN3Q13286 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLN3Q13286 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLN3Q13286 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLN3Q13286 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLN3Q13286 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLN3Q13286 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLN3Q13286 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLN3Q13286 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLN3Q13286 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLN3Q13286 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLN3Q13286 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLN3Q13286 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLN3Q13286 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLN3Q13286 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLN3Q13286 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLN3Q13286 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLN3Q13286 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLN3Q13286 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLN3Q13286 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLN3Q13286 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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