Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPA4Q13156 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPA4Q13156 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPA4Q13156 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPA4Q13156 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPA4Q13156 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPA4Q13156 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPA4Q13156 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPA4Q13156 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RPA4Q13156 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPA4Q13156 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPA4Q13156 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPA4Q13156 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPA4Q13156 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPA4Q13156 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPA4Q13156 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPA4Q13156 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPA4Q13156 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPA4Q13156 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RPA4Q13156 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPA4Q13156 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPA4Q13156 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPA4Q13156 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPA4Q13156 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPA4Q13156 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RPA4Q13156 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPA4Q13156 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPA4Q13156 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPA4Q13156 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPA4Q13156 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPA4Q13156 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPA4Q13156 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPA4Q13156 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPA4Q13156 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPA4Q13156 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RPA4Q13156 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPA4Q13156 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPA4Q13156 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPA4Q13156 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPA4Q13156 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPA4Q13156 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPA4Q13156 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPA4Q13156 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPA4Q13156 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPA4Q13156 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPA4Q13156 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPA4Q13156 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPA4Q13156 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPA4Q13156 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPA4Q13156 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RPA4Q13156 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPA4Q13156 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPA4Q13156 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPA4Q13156 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPA4Q13156 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPA4Q13156 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPA4Q13156 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPA4Q13156 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPA4Q13156 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPA4Q13156 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPA4Q13156 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RPA4Q13156 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPA4Q13156 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPA4Q13156 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPA4Q13156 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPA4Q13156 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RPA4Q13156 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPA4Q13156 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPA4Q13156 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RPA4Q13156 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPA4Q13156 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPA4Q13156 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
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RPA4Q13156 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPA4Q13156 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPA4Q13156 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPA4Q13156 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPA4Q13156 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RPA4Q13156 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPA4Q13156 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPA4Q13156 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPA4Q13156 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPA4Q13156 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPA4Q13156 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPA4Q13156 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPA4Q13156 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPA4Q13156 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPA4Q13156 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPA4Q13156 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPA4Q13156 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPA4Q13156 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPA4Q13156 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPA4Q13156 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPA4Q13156 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPA4Q13156 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPA4Q13156 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPA4Q13156 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPA4Q13156 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
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