Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKAA1Q13131 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKAA1Q13131 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKAA1Q13131 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKAA1Q13131 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKAA1Q13131 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKAA1Q13131 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKAA1Q13131 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKAA1Q13131 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKAA1Q13131 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKAA1Q13131 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKAA1Q13131 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKAA1Q13131 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKAA1Q13131 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PRKAA1Q13131 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKAA1Q13131 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKAA1Q13131 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKAA1Q13131 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKAA1Q13131 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKAA1Q13131 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKAA1Q13131 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKAA1Q13131 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKAA1Q13131 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKAA1Q13131 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKAA1Q13131 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKAA1Q13131 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKAA1Q13131 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKAA1Q13131 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKAA1Q13131 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKAA1Q13131 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKAA1Q13131 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKAA1Q13131 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKAA1Q13131 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKAA1Q13131 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKAA1Q13131 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKAA1Q13131 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKAA1Q13131 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKAA1Q13131 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKAA1Q13131 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKAA1Q13131 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKAA1Q13131 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKAA1Q13131 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKAA1Q13131 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKAA1Q13131 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKAA1Q13131 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKAA1Q13131 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKAA1Q13131 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKAA1Q13131 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKAA1Q13131 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKAA1Q13131 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKAA1Q13131 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKAA1Q13131 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKAA1Q13131 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKAA1Q13131 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKAA1Q13131 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKAA1Q13131 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKAA1Q13131 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKAA1Q13131 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKAA1Q13131 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKAA1Q13131 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKAA1Q13131 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKAA1Q13131 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKAA1Q13131 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKAA1Q13131 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKAA1Q13131 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKAA1Q13131 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKAA1Q13131 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKAA1Q13131 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKAA1Q13131 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKAA1Q13131 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKAA1Q13131 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKAA1Q13131 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKAA1Q13131 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKAA1Q13131 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKAA1Q13131 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKAA1Q13131 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKAA1Q13131 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKAA1Q13131 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKAA1Q13131 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKAA1Q13131 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKAA1Q13131 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRKAA1Q13131 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRKAA1Q13131 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRKAA1Q13131 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRKAA1Q13131 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRKAA1Q13131 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKAA1Q13131 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKAA1Q13131 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKAA1Q13131 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKAA1Q13131 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKAA1Q13131 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKAA1Q13131 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKAA1Q13131 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKAA1Q13131 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKAA1Q13131 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKAA1Q13131 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKAA1Q13131 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKAA1Q13131 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKAA1Q13131 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKAA1Q13131 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
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