Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
STRN3Q13033 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
STRN3Q13033 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
STRN3Q13033 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
STRN3Q13033 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
STRN3Q13033 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
STRN3Q13033 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
STRN3Q13033 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
STRN3Q13033 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
STRN3Q13033 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
STRN3Q13033 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
STRN3Q13033 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
STRN3Q13033 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
STRN3Q13033 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
STRN3Q13033 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
STRN3Q13033 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
STRN3Q13033 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
STRN3Q13033 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
STRN3Q13033 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
STRN3Q13033 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
STRN3Q13033 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
STRN3Q13033 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
STRN3Q13033 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
STRN3Q13033 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
STRN3Q13033 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
STRN3Q13033 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
STRN3Q13033 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
STRN3Q13033 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
STRN3Q13033 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
STRN3Q13033 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
STRN3Q13033 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
STRN3Q13033 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
STRN3Q13033 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
STRN3Q13033 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
STRN3Q13033 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
STRN3Q13033 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
STRN3Q13033 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
STRN3Q13033 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
STRN3Q13033 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
STRN3Q13033 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
STRN3Q13033 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
STRN3Q13033 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
STRN3Q13033 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
STRN3Q13033 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
STRN3Q13033 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
STRN3Q13033 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
STRN3Q13033 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
STRN3Q13033 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
STRN3Q13033 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
STRN3Q13033 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
STRN3Q13033 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
STRN3Q13033 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
STRN3Q13033 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
STRN3Q13033 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
STRN3Q13033 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
STRN3Q13033 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
STRN3Q13033 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
STRN3Q13033 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
STRN3Q13033 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
STRN3Q13033 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
STRN3Q13033 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
STRN3Q13033 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
STRN3Q13033 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
STRN3Q13033 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
STRN3Q13033 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
STRN3Q13033 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
STRN3Q13033 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
STRN3Q13033 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
STRN3Q13033 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
STRN3Q13033 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRN3Q13033 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
STRN3Q13033 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRN3Q13033 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
STRN3Q13033 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
STRN3Q13033 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRN3Q13033 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRN3Q13033 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRN3Q13033 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
STRN3Q13033 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
STRN3Q13033 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
STRN3Q13033 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
STRN3Q13033 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
STRN3Q13033 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
STRN3Q13033 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
STRN3Q13033 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
STRN3Q13033 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRN3Q13033 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRN3Q13033 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRN3Q13033 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRN3Q13033 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRN3Q13033 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRN3Q13033 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
STRN3Q13033 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
STRN3Q13033 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
STRN3Q13033 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
STRN3Q13033 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
STRN3Q13033 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
STRN3Q13033 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
STRN3Q13033 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
STRN3Q13033 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms