Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXD4Q12950 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXD4Q12950 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXD4Q12950 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXD4Q12950 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXD4Q12950 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXD4Q12950 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXD4Q12950 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXD4Q12950 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXD4Q12950 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXD4Q12950 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXD4Q12950 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXD4Q12950 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXD4Q12950 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXD4Q12950 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXD4Q12950 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXD4Q12950 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXD4Q12950 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXD4Q12950 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXD4Q12950 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXD4Q12950 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXD4Q12950 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXD4Q12950 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXD4Q12950 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXD4Q12950 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXD4Q12950 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FOXD4Q12950 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXD4Q12950 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXD4Q12950 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXD4Q12950 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXD4Q12950 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXD4Q12950 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXD4Q12950 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXD4Q12950 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXD4Q12950 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXD4Q12950 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXD4Q12950 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXD4Q12950 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXD4Q12950 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXD4Q12950 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXD4Q12950 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXD4Q12950 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXD4Q12950 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXD4Q12950 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXD4Q12950 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXD4Q12950 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXD4Q12950 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXD4Q12950 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXD4Q12950 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXD4Q12950 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXD4Q12950 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXD4Q12950 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXD4Q12950 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXD4Q12950 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXD4Q12950 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXD4Q12950 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXD4Q12950 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXD4Q12950 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXD4Q12950 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXD4Q12950 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXD4Q12950 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXD4Q12950 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXD4Q12950 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXD4Q12950 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXD4Q12950 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXD4Q12950 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXD4Q12950 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXD4Q12950 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXD4Q12950 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXD4Q12950 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXD4Q12950 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXD4Q12950 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXD4Q12950 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXD4Q12950 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXD4Q12950 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXD4Q12950 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXD4Q12950 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXD4Q12950 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXD4Q12950 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXD4Q12950 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXD4Q12950 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXD4Q12950 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXD4Q12950 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXD4Q12950 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXD4Q12950 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXD4Q12950 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXD4Q12950 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXD4Q12950 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXD4Q12950 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXD4Q12950 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXD4Q12950 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXD4Q12950 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXD4Q12950 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXD4Q12950 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXD4Q12950 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXD4Q12950 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXD4Q12950 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXD4Q12950 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXD4Q12950 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXD4Q12950 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms