Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FOXF2Q12947 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FOXF2Q12947 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FOXF2Q12947 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FOXF2Q12947 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FOXF2Q12947 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
FOXF2Q12947 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FOXF2Q12947 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FOXF2Q12947 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FOXF2Q12947 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FOXF2Q12947 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FOXF2Q12947 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FOXF2Q12947 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FOXF2Q12947 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FOXF2Q12947 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FOXF2Q12947 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FOXF2Q12947 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FOXF2Q12947 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FOXF2Q12947 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FOXF2Q12947 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FOXF2Q12947 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FOXF2Q12947 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
FOXF2Q12947 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
FOXF2Q12947 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
FOXF2Q12947 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
FOXF2Q12947 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FOXF2Q12947 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FOXF2Q12947 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FOXF2Q12947 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FOXF2Q12947 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
FOXF2Q12947 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FOXF2Q12947 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FOXF2Q12947 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FOXF2Q12947 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FOXF2Q12947 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
FOXF2Q12947 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FOXF2Q12947 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FOXF2Q12947 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FOXF2Q12947 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FOXF2Q12947 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FOXF2Q12947 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FOXF2Q12947 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FOXF2Q12947 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FOXF2Q12947 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FOXF2Q12947 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FOXF2Q12947 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FOXF2Q12947 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FOXF2Q12947 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FOXF2Q12947 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FOXF2Q12947 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FOXF2Q12947 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FOXF2Q12947 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FOXF2Q12947 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FOXF2Q12947 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FOXF2Q12947 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
FOXF2Q12947 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
FOXF2Q12947 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
FOXF2Q12947 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FOXF2Q12947 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FOXF2Q12947 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FOXF2Q12947 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FOXF2Q12947 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FOXF2Q12947 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FOXF2Q12947 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
FOXF2Q12947 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FOXF2Q12947 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FOXF2Q12947 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FOXF2Q12947 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FOXF2Q12947 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FOXF2Q12947 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FOXF2Q12947 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FOXF2Q12947 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FOXF2Q12947 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
FOXF2Q12947 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FOXF2Q12947 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FOXF2Q12947 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FOXF2Q12947 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FOXF2Q12947 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FOXF2Q12947 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXF2Q12947 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXF2Q12947 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXF2Q12947 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXF2Q12947 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXF2Q12947 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXF2Q12947 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXF2Q12947 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXF2Q12947 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXF2Q12947 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXF2Q12947 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXF2Q12947 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXF2Q12947 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXF2Q12947 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXF2Q12947 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXF2Q12947 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXF2Q12947 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXF2Q12947 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXF2Q12947 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXF2Q12947 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXF2Q12947 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXF2Q12947 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms