Protein–RNA interactions for Protein: Q12874

SF3A3, Splicing factor 3A subunit 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A3Q12874 CLCN2-211ENST00000636241 2010 ntTSL 517.44■□□□□ 0.389e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 RAD51D-213ENST00000587977 1732 ntTSL 217.41■□□□□ 0.389e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.389e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.369e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.359e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 TMEM63B-209ENST00000533121 2465 ntTSL 1 (best)17.22■□□□□ 0.359e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 PEX5-219ENST00000545574 878 ntTSL 517.17■□□□□ 0.349e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.339e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.339e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 FANCG-202ENST00000425676 2108 ntTSL 1 (best)17.06■□□□□ 0.329e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 ADAMTSL5-205ENST00000586272 735 ntTSL 316.97■□□□□ 0.319e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 KCTD2-202ENST00000375286 3582 ntTSL 1 (best)16.97■□□□□ 0.319e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 PELP1-213ENST00000575101 442 ntTSL 316.96■□□□□ 0.319e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 CLCN2-222ENST00000638134 2118 ntTSL 516.88■□□□□ 0.299e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.299e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 RDH13-221ENST00000592573 1481 ntTSL 216.8■□□□□ 0.289e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 POMT2-213ENST00000556171 580 ntTSL 316.73■□□□□ 0.279e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.279e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 QTRT1-202ENST00000421333 1502 ntTSL 216.69■□□□□ 0.269e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 DGKZ-215ENST00000528173 5737 ntTSL 516.66■□□□□ 0.269e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 ARHGAP45-214ENST00000591293 645 ntTSL 316.63■□□□□ 0.253e-6■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 IZUMO4-211ENST00000593185 462 ntTSL 216.6■□□□□ 0.259e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.249e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 PEX5-203ENST00000396637 1508 ntTSL 516.51■□□□□ 0.239e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 COPS6-210ENST00000496358 610 ntTSL 216.5■□□□□ 0.239e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.239e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.239e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 MEST-208ENST00000427521 882 ntTSL 516.45■□□□□ 0.229e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 DDX51-206ENST00000546058 789 ntTSL 516.41■□□□□ 0.229e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 METAP1D-204ENST00000488581 958 ntTSL 316.4■□□□□ 0.229e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 OFD1-208ENST00000485052 685 ntTSL 316.38■□□□□ 0.219e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 CLCN2-220ENST00000637538 1545 ntTSL 516.34■□□□□ 0.219e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 PEX5-217ENST00000544456 579 ntTSL 416.33■□□□□ 0.29e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.193e-6■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 SUCLG2-202ENST00000460567 1596 ntTSL 1 (best)16.21■□□□□ 0.199e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 OGDHL-205ENST00000490844 2651 ntTSL 216.21■□□□□ 0.199e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 PRKACA-207ENST00000589284 403 ntTSL 516.12■□□□□ 0.179e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 ZFPM1-202ENST00000562417 497 ntTSL 316.1■□□□□ 0.175e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 ADAMTSL5-209ENST00000590562 573 ntTSL 416.07■□□□□ 0.169e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 MAPK8IP3-208ENST00000564868 870 ntTSL 316.06■□□□□ 0.169e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.163e-6■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 PEX5-208ENST00000535486 560 ntTSL 416.04■□□□□ 0.169e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.169e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 ACD-205ENST00000602423 386 ntTSL 316.02■□□□□ 0.169e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.159e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 HYOU1-214ENST00000534233 711 ntTSL 216■□□□□ 0.159e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 MIIP-207ENST00000498685 1392 ntTSL 216■□□□□ 0.159e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.159e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.143e-6■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 QTRT1-205ENST00000587599 994 ntTSL 315.9■□□□□ 0.149e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.133e-6■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 RAD51D-211ENST00000586210 1194 ntTSL 1 (best)15.88■□□□□ 0.139e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.129e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.129e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.123e-6■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.119e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 QTRT1-208ENST00000590705 846 ntTSL 315.72■□□□□ 0.119e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.119e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.19e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.099e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.099e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.099e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 ARHGAP45-209ENST00000587602 3875 ntTSL 215.52■□□□□ 0.073e-6■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 RAD51D-209ENST00000586044 1571 ntTSL 1 (best)15.48■□□□□ 0.079e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.059e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 RDH13-201ENST00000291892 3022 ntTSL 215.36■□□□□ 0.059e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.049e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.043e-6■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 ACD-206ENST00000602519 997 ntTSL 215.25■□□□□ 0.039e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 PEX5-209ENST00000536841 567 ntTSL 215.23■□□□□ 0.039e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.019e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 ANKRD27-207ENST00000590519 1067 ntTSL 515.09■□□□□ 0.019e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -03e-6■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.029e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.029e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 DGKZ-208ENST00000524984 3512 ntTSL 214.91□□□□□ -0.029e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.033e-6■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 CDT1-202ENST00000562747 735 ntTSL 214.87□□□□□ -0.039e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 MYO18A-206ENST00000529889 698 ntTSL 214.83□□□□□ -0.049e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 ARHGAP45-210ENST00000590214 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.043e-6■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 LYPLA2-207ENST00000421070 429 ntTSL 514.79□□□□□ -0.049e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 PSMC4-206ENST00000601697 1623 ntTSL 214.78□□□□□ -0.042e-12■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 WDR59-214ENST00000568323 558 ntTSL 514.78□□□□□ -0.049e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 LYPLA2-210ENST00000495365 842 ntTSL 214.77□□□□□ -0.059e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.059e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 SLC26A11-208ENST00000571602 766 ntTSL 314.74□□□□□ -0.059e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 NT5DC2-210ENST00000479024 1714 ntTSL 214.72□□□□□ -0.059e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.079e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 QTRT1-210ENST00000592254 539 ntTSL 314.64□□□□□ -0.079e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 DGKZ-204ENST00000454345 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.079e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.079e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 MIIP-202ENST00000460823 955 ntTSL 514.61□□□□□ -0.079e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 C11orf98-203ENST00000532786 774 ntTSL 214.6□□□□□ -0.079e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 MKNK2-204ENST00000586620 1135 ntTSL 214.56□□□□□ -0.089e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.089e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.099e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 TAF15-210ENST00000604694 891 ntTSL 514.43□□□□□ -0.19e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 WDR46-234ENST00000468157 760 ntTSL 514.43□□□□□ -0.19e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 HYOU1-205ENST00000529174 549 ntTSL 414.43□□□□□ -0.19e-7■■■■■ 44.5
SF3A3Q12874 PLEKHH3-208ENST00000591544 617 ntTSL 314.41□□□□□ -0.12e-12■■■■■ 44.5
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