Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RAB40BQ12829 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB40BQ12829 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB40BQ12829 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB40BQ12829 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
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RAB40BQ12829 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
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RAB40BQ12829 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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RAB40BQ12829 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
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RAB40BQ12829 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB40BQ12829 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB40BQ12829 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB40BQ12829 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAB40BQ12829 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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RAB40BQ12829 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB40BQ12829 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB40BQ12829 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB40BQ12829 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB40BQ12829 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB40BQ12829 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB40BQ12829 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAB40BQ12829 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
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