Protein–RNA interactions for Protein: Q12815

TROAP, Tastin, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROAPQ12815 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TROAPQ12815 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TROAPQ12815 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TROAPQ12815 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TROAPQ12815 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TROAPQ12815 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TROAPQ12815 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TROAPQ12815 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TROAPQ12815 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TROAPQ12815 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TROAPQ12815 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TROAPQ12815 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TROAPQ12815 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TROAPQ12815 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TROAPQ12815 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TROAPQ12815 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TROAPQ12815 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TROAPQ12815 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TROAPQ12815 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TROAPQ12815 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TROAPQ12815 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TROAPQ12815 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TROAPQ12815 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TROAPQ12815 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TROAPQ12815 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TROAPQ12815 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TROAPQ12815 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TROAPQ12815 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TROAPQ12815 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TROAPQ12815 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TROAPQ12815 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TROAPQ12815 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TROAPQ12815 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TROAPQ12815 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TROAPQ12815 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TROAPQ12815 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TROAPQ12815 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TROAPQ12815 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TROAPQ12815 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TROAPQ12815 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TROAPQ12815 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TROAPQ12815 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TROAPQ12815 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TROAPQ12815 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TROAPQ12815 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TROAPQ12815 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TROAPQ12815 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TROAPQ12815 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TROAPQ12815 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TROAPQ12815 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TROAPQ12815 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TROAPQ12815 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TROAPQ12815 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TROAPQ12815 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TROAPQ12815 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TROAPQ12815 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TROAPQ12815 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TROAPQ12815 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TROAPQ12815 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TROAPQ12815 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TROAPQ12815 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TROAPQ12815 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TROAPQ12815 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TROAPQ12815 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TROAPQ12815 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TROAPQ12815 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TROAPQ12815 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TROAPQ12815 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TROAPQ12815 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TROAPQ12815 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TROAPQ12815 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TROAPQ12815 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TROAPQ12815 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TROAPQ12815 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TROAPQ12815 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TROAPQ12815 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TROAPQ12815 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TROAPQ12815 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TROAPQ12815 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TROAPQ12815 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TROAPQ12815 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TROAPQ12815 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TROAPQ12815 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TROAPQ12815 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TROAPQ12815 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TROAPQ12815 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TROAPQ12815 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TROAPQ12815 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TROAPQ12815 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TROAPQ12815 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TROAPQ12815 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TROAPQ12815 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TROAPQ12815 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TROAPQ12815 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TROAPQ12815 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TROAPQ12815 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TROAPQ12815 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TROAPQ12815 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TROAPQ12815 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TROAPQ12815 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms