Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TFCP2Q12800 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TFCP2Q12800 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
TFCP2Q12800 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TFCP2Q12800 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TFCP2Q12800 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TFCP2Q12800 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TFCP2Q12800 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TFCP2Q12800 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TFCP2Q12800 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TFCP2Q12800 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TFCP2Q12800 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TFCP2Q12800 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TFCP2Q12800 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TFCP2Q12800 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TFCP2Q12800 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
TFCP2Q12800 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
TFCP2Q12800 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TFCP2Q12800 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TFCP2Q12800 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TFCP2Q12800 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TFCP2Q12800 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TFCP2Q12800 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TFCP2Q12800 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TFCP2Q12800 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TFCP2Q12800 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TFCP2Q12800 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
TFCP2Q12800 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TFCP2Q12800 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TFCP2Q12800 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TFCP2Q12800 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TFCP2Q12800 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TFCP2Q12800 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TFCP2Q12800 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TFCP2Q12800 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
TFCP2Q12800 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TFCP2Q12800 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TFCP2Q12800 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TFCP2Q12800 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TFCP2Q12800 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TFCP2Q12800 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
TFCP2Q12800 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TFCP2Q12800 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TFCP2Q12800 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TFCP2Q12800 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TFCP2Q12800 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TFCP2Q12800 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TFCP2Q12800 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TFCP2Q12800 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TFCP2Q12800 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TFCP2Q12800 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TFCP2Q12800 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TFCP2Q12800 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TFCP2Q12800 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TFCP2Q12800 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TFCP2Q12800 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TFCP2Q12800 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TFCP2Q12800 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TFCP2Q12800 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TFCP2Q12800 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TFCP2Q12800 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TFCP2Q12800 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TFCP2Q12800 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TFCP2Q12800 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TFCP2Q12800 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TFCP2Q12800 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TFCP2Q12800 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TFCP2Q12800 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TFCP2Q12800 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TFCP2Q12800 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TFCP2Q12800 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TFCP2Q12800 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TFCP2Q12800 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
TFCP2Q12800 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TFCP2Q12800 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TFCP2Q12800 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TFCP2Q12800 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TFCP2Q12800 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
TFCP2Q12800 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TFCP2Q12800 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TFCP2Q12800 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TFCP2Q12800 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TFCP2Q12800 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TFCP2Q12800 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TFCP2Q12800 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TFCP2Q12800 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TFCP2Q12800 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TFCP2Q12800 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TFCP2Q12800 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TFCP2Q12800 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TFCP2Q12800 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TFCP2Q12800 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TFCP2Q12800 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TFCP2Q12800 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TFCP2Q12800 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TFCP2Q12800 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
TFCP2Q12800 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
TFCP2Q12800 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TFCP2Q12800 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TFCP2Q12800 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
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