Protein–RNA interactions for Protein: Q12266

TY1A-BL, Transposon Ty1-BL Gag polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-BLQ12266 YFL012W-AYFL012W-A 375 nt6.96□□□□□ -1.3
TY1A-BLQ12266 AIM20YIL158W 615 nt6.96□□□□□ -1.3
TY1A-BLQ12266 NFU1YKL040C 771 nt6.96□□□□□ -1.3
TY1A-BLQ12266 UTP30YKR060W 825 nt6.96□□□□□ -1.3
TY1A-BLQ12266 RRT7YLL030C 342 nt6.96□□□□□ -1.3
TY1A-BLQ12266 YBR056C-BYBR056C-B 159 nt6.96□□□□□ -1.3
TY1A-BLQ12266 FCY1YPR062W 477 nt6.96□□□□□ -1.3
TY1A-BLQ12266 DAS2YDR020C 699 nt6.95□□□□□ -1.3
TY1A-BLQ12266 TRR1YDR353W 960 nt6.95□□□□□ -1.3
TY1A-BLQ12266 EMC4YGL231C 573 nt6.95□□□□□ -1.3
TY1A-BLQ12266 RRT14YIL127C 621 nt6.95□□□□□ -1.3
TY1A-BLQ12266 POM33YLL023C 840 nt6.95□□□□□ -1.3
TY1A-BLQ12266 IRC19YLL033W 693 nt6.95□□□□□ -1.3
TY1A-BLQ12266 RCF1YML030W 480 nt6.95□□□□□ -1.3
TY1A-BLQ12266 YMR085WYMR085W 1299 nt6.95□□□□□ -1.3
TY1A-BLQ12266 AIF1YNR074C 1137 nt6.95□□□□□ -1.3
TY1A-BLQ12266 UME1YPL139C 1383 nt6.95□□□□□ -1.3
TY1A-BLQ12266 HXT8YJL214W 1710 nt6.94□□□□□ -1.3
TY1A-BLQ12266 YCP4YCR004C 744 nt6.94□□□□□ -1.3
TY1A-BLQ12266 ARO3YDR035W 1113 nt6.94□□□□□ -1.3
TY1A-BLQ12266 DET1YDR051C 1005 nt6.94□□□□□ -1.3
TY1A-BLQ12266 YDR157WYDR157W 402 nt6.94□□□□□ -1.3
TY1A-BLQ12266 TLG1YDR468C 675 nt6.94□□□□□ -1.3
TY1A-BLQ12266 PUP3YER094C 618 nt6.94□□□□□ -1.3
TY1A-BLQ12266 CTR2YHR175W 570 nt6.94□□□□□ -1.3
TY1A-BLQ12266 THI11YJR156C 1023 nt6.94□□□□□ -1.3
TY1A-BLQ12266 ATP10YLR393W 840 nt6.94□□□□□ -1.3
TY1A-BLQ12266 YNL058CYNL058C 951 nt6.94□□□□□ -1.3
TY1A-BLQ12266 FMP23YBR047W 528 nt6.94□□□□□ -1.3
TY1A-BLQ12266 HUT1YPL244C 1020 nt6.94□□□□□ -1.3
TY1A-BLQ12266 UBA3YPR066W 900 nt6.94□□□□□ -1.3
TY1A-BLQ12266 ARO4YBR249C 1113 nt6.94□□□□□ -1.3
TY1A-BLQ12266 TRS20YBR254C 528 nt6.94□□□□□ -1.3
TY1A-BLQ12266 TOP3YLR234W 1971 nt6.94□□□□□ -1.3
TY1A-BLQ12266 RSC58YLR033W 1509 nt6.94□□□□□ -1.3
TY1A-BLQ12266 PMT1YDL095W 2454 nt6.94□□□□□ -1.3
TY1A-BLQ12266 THI73YLR004C 1572 nt6.94□□□□□ -1.3
TY1A-BLQ12266 SPO23YBR250W 1572 nt6.94□□□□□ -1.3
TY1A-BLQ12266 RSC9YML127W 1746 nt6.93□□□□□ -1.3
TY1A-BLQ12266 IWR1YDL115C 1062 nt6.93□□□□□ -1.3
TY1A-BLQ12266 YDR215CYDR215C 414 nt6.93□□□□□ -1.3
TY1A-BLQ12266 APQ13YJL075C 417 nt6.93□□□□□ -1.3
TY1A-BLQ12266 DID4YKL002W 699 nt6.93□□□□□ -1.3
TY1A-BLQ12266 SWD2YKL018W 990 nt6.93□□□□□ -1.3
TY1A-BLQ12266 COQ9YLR201C 783 nt6.93□□□□□ -1.3
TY1A-BLQ12266 YBR051WYBR051W 351 nt6.93□□□□□ -1.3
TY1A-BLQ12266 BUD22YMR014W 1560 nt6.93□□□□□ -1.3
TY1A-BLQ12266 VRP1YLR337C 2454 nt6.93□□□□□ -1.3
TY1A-BLQ12266 WSC3YOL105C 1671 nt6.93□□□□□ -1.3
TY1A-BLQ12266 APJ1YNL077W 1587 nt6.92□□□□□ -1.3
TY1A-BLQ12266 snR63snR63 255 nt6.92□□□□□ -1.3
TY1A-BLQ12266 SNM1YDR478W 597 nt6.92□□□□□ -1.3
TY1A-BLQ12266 CHO1YER026C 831 nt6.92□□□□□ -1.3
TY1A-BLQ12266 LYS5YGL154C 819 nt6.92□□□□□ -1.3
TY1A-BLQ12266 PDE1YGL248W 1110 nt6.92□□□□□ -1.3
TY1A-BLQ12266 YJL160CYJL160C 864 nt6.92□□□□□ -1.3
TY1A-BLQ12266 YLR225CYLR225C 1224 nt6.92□□□□□ -1.3
TY1A-BLQ12266 YML003WYML003W 873 nt6.92□□□□□ -1.3
TY1A-BLQ12266 YMR030W-AYMR030W-A 291 nt6.92□□□□□ -1.3
TY1A-BLQ12266 YOR199WYOR199W 330 nt6.92□□□□□ -1.3
TY1A-BLQ12266 MRPS9YBR146W 837 nt6.92□□□□□ -1.3
TY1A-BLQ12266 SIP5YMR140W 1470 nt6.92□□□□□ -1.3
TY1A-BLQ12266 YCR085WYCR085W 354 nt6.91□□□□□ -1.3
TY1A-BLQ12266 SCM3YDL139C 672 nt6.91□□□□□ -1.3
TY1A-BLQ12266 KEG1YFR042W 603 nt6.91□□□□□ -1.3
TY1A-BLQ12266 YGR270C-AYGR270C-A 219 nt6.91□□□□□ -1.3
TY1A-BLQ12266 PEX18YHR160C 852 nt6.91□□□□□ -1.3
TY1A-BLQ12266 RIF2YLR453C 1188 nt6.91□□□□□ -1.3
TY1A-BLQ12266 ERG6YML008C 1152 nt6.91□□□□□ -1.3
TY1A-BLQ12266 OGG1YML060W 1131 nt6.91□□□□□ -1.3
TY1A-BLQ12266 BXI1YNL305C 894 nt6.91□□□□□ -1.3
TY1A-BLQ12266 CDC21YOR074C 915 nt6.91□□□□□ -1.3
TY1A-BLQ12266 YBR144CYBR144C 315 nt6.91□□□□□ -1.3
TY1A-BLQ12266 YDR018CYDR018C 1191 nt6.9□□□□□ -1.3
TY1A-BLQ12266 YGR137WYGR137W 375 nt6.9□□□□□ -1.3
TY1A-BLQ12266 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt6.9□□□□□ -1.3
TY1A-BLQ12266 RFA3YJL173C 369 nt6.9□□□□□ -1.3
TY1A-BLQ12266 SML1YML058W 315 nt6.9□□□□□ -1.3
TY1A-BLQ12266 RRN10YBL025W 438 nt6.9□□□□□ -1.3
TY1A-BLQ12266 YIM1YMR152W 1098 nt6.9□□□□□ -1.3
TY1A-BLQ12266 YNL046WYNL046W 519 nt6.9□□□□□ -1.3
TY1A-BLQ12266 ATP19YOL077W-A 207 nt6.9□□□□□ -1.3
TY1A-BLQ12266 SPC29YPL124W 762 nt6.9□□□□□ -1.3
TY1A-BLQ12266 VAB2YEL005C 849 nt6.89□□□□□ -1.31
TY1A-BLQ12266 CKB1YGL019W 837 nt6.89□□□□□ -1.31
TY1A-BLQ12266 FMO1YHR176W 1299 nt6.89□□□□□ -1.31
TY1A-BLQ12266 GAT3YLR013W 426 nt6.89□□□□□ -1.31
TY1A-BLQ12266 YML053CYML053C 639 nt6.89□□□□□ -1.31
TY1A-BLQ12266 ERR3YMR323W 1314 nt6.89□□□□□ -1.31
TY1A-BLQ12266 ERR1YOR393W 1314 nt6.89□□□□□ -1.31
TY1A-BLQ12266 ERR2YPL281C 1314 nt6.89□□□□□ -1.31
TY1A-BLQ12266 VHS1YDR247W 1386 nt6.89□□□□□ -1.31
TY1A-BLQ12266 YHR131CYHR131C 2553 nt6.88□□□□□ -1.31
TY1A-BLQ12266 TPO1YLL028W 1761 nt6.88□□□□□ -1.31
TY1A-BLQ12266 GSH2YOL049W 1476 nt6.88□□□□□ -1.31
TY1A-BLQ12266 IVY1YDR229W 1362 nt6.88□□□□□ -1.31
TY1A-BLQ12266 DEG1YFL001W 1329 nt6.88□□□□□ -1.31
TY1A-BLQ12266 BUG1YDL099W 1026 nt6.88□□□□□ -1.31
TY1A-BLQ12266 MIX14YDR031W 366 nt6.88□□□□□ -1.31
TY1A-BLQ12266 PLP1YDR183W 693 nt6.88□□□□□ -1.31
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