Protein–RNA interactions for Protein: Q12173

TY3A-G, Transposon Ty3-G Gag polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY3A-GQ12173 PAT1YCR077C 2391 nt5.88□□□□□ -1.47
TY3A-GQ12173 VPS72YDR485C 2388 nt5.88□□□□□ -1.47
TY3A-GQ12173 FET3YMR058W 1911 nt5.88□□□□□ -1.47
TY3A-GQ12173 SUA5YGL169W 1281 nt5.88□□□□□ -1.47
TY3A-GQ12173 CAB4YGR277C 918 nt5.88□□□□□ -1.47
TY3A-GQ12173 FAF1YIL019W 1041 nt5.88□□□□□ -1.47
TY3A-GQ12173 MRL1YPR079W 1146 nt5.88□□□□□ -1.47
TY3A-GQ12173 EMP46YLR080W 1335 nt5.88□□□□□ -1.47
TY3A-GQ12173 BZZ1YHR114W 1902 nt5.87□□□□□ -1.47
TY3A-GQ12173 PTK2YJR059W 2457 nt5.87□□□□□ -1.47
TY3A-GQ12173 RPL7AYGL076C 735 nt5.87□□□□□ -1.47
TY3A-GQ12173 COX18YGR062C 951 nt5.87□□□□□ -1.47
TY3A-GQ12173 TAL1YLR354C 1008 nt5.87□□□□□ -1.47
TY3A-GQ12173 RPL7BYPL198W 735 nt5.87□□□□□ -1.47
TY3A-GQ12173 HOS1YPR068C 1413 nt5.87□□□□□ -1.47
TY3A-GQ12173 MID1YNL291C 1647 nt5.87□□□□□ -1.47
TY3A-GQ12173 UTP7YER082C 1665 nt5.87□□□□□ -1.47
TY3A-GQ12173 AMA1YGR225W 1782 nt5.87□□□□□ -1.47
TY3A-GQ12173 NOP2YNL061W 1857 nt5.86□□□□□ -1.47
TY3A-GQ12173 GEX2YKR106W 1848 nt5.86□□□□□ -1.47
TY3A-GQ12173 FOB1YDR110W 1701 nt5.86□□□□□ -1.47
TY3A-GQ12173 YMR111CYMR111C 1389 nt5.86□□□□□ -1.47
TY3A-GQ12173 NHP6AYPR052C 282 nt5.86□□□□□ -1.47
TY3A-GQ12173 GCS1YDL226C 1059 nt5.85□□□□□ -1.47
TY3A-GQ12173 MSH1YHR120W 2880 nt5.84□□□□□ -1.47
TY3A-GQ12173 GFD1YMR255W 567 nt5.84□□□□□ -1.47
TY3A-GQ12173 TOM5YPR133W-A 153 nt5.84□□□□□ -1.47
TY3A-GQ12173 KEX2YNL238W 2445 nt5.84□□□□□ -1.48
TY3A-GQ12173 NOP8YOL144W 1455 nt5.83□□□□□ -1.48
TY3A-GQ12173 PPR1YLR014C 2715 nt5.83□□□□□ -1.48
TY3A-GQ12173 YIL171W-AYIL171W-A 453 nt5.83□□□□□ -1.48
TY3A-GQ12173 YJL220WYJL220W 453 nt5.83□□□□□ -1.48
TY3A-GQ12173 COX17YLL009C 210 nt5.83□□□□□ -1.48
TY3A-GQ12173 ALD6YPL061W 1503 nt5.83□□□□□ -1.48
TY3A-GQ12173 ERG7YHR072W 2196 nt5.83□□□□□ -1.48
TY3A-GQ12173 RPN12YFR052W 825 nt5.82□□□□□ -1.48
TY3A-GQ12173 PEX22YAL055W 543 nt5.82□□□□□ -1.48
TY3A-GQ12173 RPP0YLR340W 939 nt5.82□□□□□ -1.48
TY3A-GQ12173 VMA4YOR332W 702 nt5.82□□□□□ -1.48
TY3A-GQ12173 NHP6BYBR089C-A 300 nt5.82□□□□□ -1.48
TY3A-GQ12173 SKN1YGR143W 2316 nt5.82□□□□□ -1.48
TY3A-GQ12173 YPS7YDR349C 1791 nt5.82□□□□□ -1.48
TY3A-GQ12173 DRS1YLL008W 2259 nt5.82□□□□□ -1.48
TY3A-GQ12173 TDA6YPR157W 1404 nt5.82□□□□□ -1.48
TY3A-GQ12173 DED81YHR019C 1665 nt5.82□□□□□ -1.48
TY3A-GQ12173 FEX1YOR390W 1128 nt5.81□□□□□ -1.48
TY3A-GQ12173 MGR2YPL098C 342 nt5.81□□□□□ -1.48
TY3A-GQ12173 FEX2YPL279C 1128 nt5.81□□□□□ -1.48
TY3A-GQ12173 PDB1YBR221C 1101 nt5.81□□□□□ -1.48
TY3A-GQ12173 HSP150YJL159W 1242 nt5.8□□□□□ -1.48
TY3A-GQ12173 YJL171CYJL171C 1191 nt5.8□□□□□ -1.48
TY3A-GQ12173 CRZ1YNL027W 2037 nt5.8□□□□□ -1.48
TY3A-GQ12173 CCZ1YBR131W 2115 nt5.8□□□□□ -1.48
TY3A-GQ12173 PXR1YGR280C 816 nt5.79□□□□□ -1.48
TY3A-GQ12173 TAH18YPR048W 1872 nt5.79□□□□□ -1.48
TY3A-GQ12173 YIL067CYIL067C 2037 nt5.79□□□□□ -1.48
TY3A-GQ12173 ULA1YPL003W 1389 nt5.79□□□□□ -1.48
TY3A-GQ12173 ACC1YNR016C 6702 nt5.78□□□□□ -1.48
TY3A-GQ12173 AAP1YHR047C 2571 nt5.78□□□□□ -1.48
TY3A-GQ12173 YDR541CYDR541C 1035 nt5.78□□□□□ -1.48
TY3A-GQ12173 MCM6YGL201C 3054 nt5.78□□□□□ -1.48
TY3A-GQ12173 CLB1YGR108W 1416 nt5.78□□□□□ -1.48
TY3A-GQ12173 COQ6YGR255C 1440 nt5.78□□□□□ -1.48
TY3A-GQ12173 DRN1YGR093W 1524 nt5.78□□□□□ -1.48
TY3A-GQ12173 NUP116YMR047C 3342 nt5.77□□□□□ -1.48
TY3A-GQ12173 APN1YKL114C 1104 nt5.77□□□□□ -1.49
TY3A-GQ12173 SPC34YKR037C 888 nt5.77□□□□□ -1.49
TY3A-GQ12173 ROX3YBL093C 663 nt5.77□□□□□ -1.49
TY3A-GQ12173 ARO10YDR380W 1908 nt5.77□□□□□ -1.49
TY3A-GQ12173 PYC1YGL062W 3537 nt5.77□□□□□ -1.49
TY3A-GQ12173 YEH1YLL012W 1722 nt5.77□□□□□ -1.49
TY3A-GQ12173 MPM1YJL066C 759 nt5.76□□□□□ -1.49
TY3A-GQ12173 RBA50YDR527W 1320 nt5.75□□□□□ -1.49
TY3A-GQ12173 IDP1YDL066W 1287 nt5.75□□□□□ -1.49
TY3A-GQ12173 MTQ2YDR140W 666 nt5.75□□□□□ -1.49
TY3A-GQ12173 ARP1YHR129C 1155 nt5.75□□□□□ -1.49
TY3A-GQ12173 YKR073CYKR073C 321 nt5.75□□□□□ -1.49
TY3A-GQ12173 CCS1YMR038C 750 nt5.75□□□□□ -1.49
TY3A-GQ12173 YNL108CYNL108C 813 nt5.75□□□□□ -1.49
TY3A-GQ12173 APJ1YNL077W 1587 nt5.75□□□□□ -1.49
TY3A-GQ12173 YPT32YGL210W 669 nt5.74□□□□□ -1.49
TY3A-GQ12173 JJJ3YJR097W 519 nt5.74□□□□□ -1.49
TY3A-GQ12173 SEC17YBL050W 879 nt5.74□□□□□ -1.49
TY3A-GQ12173 MKC7YDR144C 1791 nt5.73□□□□□ -1.49
TY3A-GQ12173 MNN10YDR245W 1182 nt5.73□□□□□ -1.49
TY3A-GQ12173 GPM3YOL056W 912 nt5.73□□□□□ -1.49
TY3A-GQ12173 MRP51YPL118W 1035 nt5.73□□□□□ -1.49
TY3A-GQ12173 SAC6YDR129C 1929 nt5.72□□□□□ -1.49
TY3A-GQ12173 LSG1YGL099W 1923 nt5.72□□□□□ -1.49
TY3A-GQ12173 BAP2YBR068C 1830 nt5.72□□□□□ -1.49
TY3A-GQ12173 STE13YOR219C 2796 nt5.72□□□□□ -1.49
TY3A-GQ12173 YDR396WYDR396W 501 nt5.72□□□□□ -1.49
TY3A-GQ12173 VAM7YGL212W 951 nt5.72□□□□□ -1.49
TY3A-GQ12173 ARG8YOL140W 1272 nt5.72□□□□□ -1.49
TY3A-GQ12173 CAM1YPL048W 1248 nt5.72□□□□□ -1.49
TY3A-GQ12173 TNA1YGR260W 1605 nt5.71□□□□□ -1.5
TY3A-GQ12173 RBD2YPL246C 789 nt5.71□□□□□ -1.5
TY3A-GQ12173 ENP1YBR247C 1452 nt5.71□□□□□ -1.5
TY3A-GQ12173 ATP1YBL099W 1638 nt5.7□□□□□ -1.5
TY3A-GQ12173 MET7YOR241W 1647 nt5.7□□□□□ -1.5
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