Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFFO1Q0D2I5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFFO1Q0D2I5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFFO1Q0D2I5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFFO1Q0D2I5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFFO1Q0D2I5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFFO1Q0D2I5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFFO1Q0D2I5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFFO1Q0D2I5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
IFFO1Q0D2I5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFFO1Q0D2I5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
IFFO1Q0D2I5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IFFO1Q0D2I5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IFFO1Q0D2I5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
IFFO1Q0D2I5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
IFFO1Q0D2I5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
IFFO1Q0D2I5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IFFO1Q0D2I5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
IFFO1Q0D2I5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
IFFO1Q0D2I5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
IFFO1Q0D2I5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
IFFO1Q0D2I5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
IFFO1Q0D2I5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
IFFO1Q0D2I5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IFFO1Q0D2I5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IFFO1Q0D2I5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IFFO1Q0D2I5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
IFFO1Q0D2I5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFFO1Q0D2I5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
IFFO1Q0D2I5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFFO1Q0D2I5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFFO1Q0D2I5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFFO1Q0D2I5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFFO1Q0D2I5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFFO1Q0D2I5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFFO1Q0D2I5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFFO1Q0D2I5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFFO1Q0D2I5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFFO1Q0D2I5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFFO1Q0D2I5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFFO1Q0D2I5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFFO1Q0D2I5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFFO1Q0D2I5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFFO1Q0D2I5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFFO1Q0D2I5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFFO1Q0D2I5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFFO1Q0D2I5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFFO1Q0D2I5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
IFFO1Q0D2I5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFFO1Q0D2I5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFFO1Q0D2I5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFFO1Q0D2I5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFFO1Q0D2I5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFFO1Q0D2I5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFFO1Q0D2I5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFFO1Q0D2I5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFFO1Q0D2I5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFFO1Q0D2I5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFFO1Q0D2I5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFFO1Q0D2I5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IFFO1Q0D2I5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IFFO1Q0D2I5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IFFO1Q0D2I5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IFFO1Q0D2I5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IFFO1Q0D2I5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IFFO1Q0D2I5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IFFO1Q0D2I5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
IFFO1Q0D2I5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
IFFO1Q0D2I5 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFFO1Q0D2I5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFFO1Q0D2I5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFFO1Q0D2I5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFFO1Q0D2I5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFFO1Q0D2I5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFFO1Q0D2I5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFFO1Q0D2I5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFFO1Q0D2I5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFFO1Q0D2I5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFFO1Q0D2I5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IFFO1Q0D2I5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IFFO1Q0D2I5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IFFO1Q0D2I5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IFFO1Q0D2I5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IFFO1Q0D2I5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
IFFO1Q0D2I5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IFFO1Q0D2I5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IFFO1Q0D2I5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IFFO1Q0D2I5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IFFO1Q0D2I5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IFFO1Q0D2I5 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IFFO1Q0D2I5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IFFO1Q0D2I5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IFFO1Q0D2I5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IFFO1Q0D2I5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IFFO1Q0D2I5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IFFO1Q0D2I5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IFFO1Q0D2I5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IFFO1Q0D2I5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IFFO1Q0D2I5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IFFO1Q0D2I5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms