Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE4CQ08493 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE4CQ08493 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE4CQ08493 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE4CQ08493 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE4CQ08493 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE4CQ08493 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE4CQ08493 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE4CQ08493 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE4CQ08493 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE4CQ08493 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE4CQ08493 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE4CQ08493 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE4CQ08493 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE4CQ08493 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE4CQ08493 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE4CQ08493 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE4CQ08493 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE4CQ08493 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE4CQ08493 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE4CQ08493 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE4CQ08493 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE4CQ08493 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE4CQ08493 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE4CQ08493 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE4CQ08493 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PDE4CQ08493 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE4CQ08493 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE4CQ08493 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE4CQ08493 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE4CQ08493 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE4CQ08493 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE4CQ08493 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE4CQ08493 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE4CQ08493 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE4CQ08493 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE4CQ08493 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE4CQ08493 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE4CQ08493 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE4CQ08493 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE4CQ08493 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE4CQ08493 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE4CQ08493 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE4CQ08493 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE4CQ08493 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE4CQ08493 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE4CQ08493 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE4CQ08493 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE4CQ08493 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE4CQ08493 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE4CQ08493 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE4CQ08493 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE4CQ08493 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE4CQ08493 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE4CQ08493 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE4CQ08493 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE4CQ08493 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE4CQ08493 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE4CQ08493 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE4CQ08493 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE4CQ08493 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE4CQ08493 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE4CQ08493 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE4CQ08493 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE4CQ08493 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE4CQ08493 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE4CQ08493 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE4CQ08493 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE4CQ08493 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE4CQ08493 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE4CQ08493 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE4CQ08493 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE4CQ08493 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE4CQ08493 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE4CQ08493 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE4CQ08493 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE4CQ08493 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE4CQ08493 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE4CQ08493 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE4CQ08493 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE4CQ08493 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE4CQ08493 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE4CQ08493 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE4CQ08493 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE4CQ08493 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE4CQ08493 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE4CQ08493 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE4CQ08493 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE4CQ08493 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE4CQ08493 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE4CQ08493 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE4CQ08493 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE4CQ08493 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE4CQ08493 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE4CQ08493 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE4CQ08493 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE4CQ08493 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE4CQ08493 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE4CQ08493 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE4CQ08493 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms