Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DHX9Q08211 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DHX9Q08211 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DHX9Q08211 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DHX9Q08211 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DHX9Q08211 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DHX9Q08211 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DHX9Q08211 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DHX9Q08211 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DHX9Q08211 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DHX9Q08211 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DHX9Q08211 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DHX9Q08211 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DHX9Q08211 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DHX9Q08211 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DHX9Q08211 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DHX9Q08211 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DHX9Q08211 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
DHX9Q08211 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DHX9Q08211 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DHX9Q08211 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DHX9Q08211 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DHX9Q08211 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DHX9Q08211 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DHX9Q08211 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DHX9Q08211 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DHX9Q08211 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DHX9Q08211 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DHX9Q08211 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DHX9Q08211 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DHX9Q08211 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DHX9Q08211 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DHX9Q08211 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DHX9Q08211 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DHX9Q08211 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DHX9Q08211 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DHX9Q08211 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DHX9Q08211 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DHX9Q08211 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DHX9Q08211 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DHX9Q08211 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DHX9Q08211 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DHX9Q08211 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DHX9Q08211 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DHX9Q08211 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
DHX9Q08211 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DHX9Q08211 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DHX9Q08211 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DHX9Q08211 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DHX9Q08211 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DHX9Q08211 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DHX9Q08211 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DHX9Q08211 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DHX9Q08211 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DHX9Q08211 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DHX9Q08211 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DHX9Q08211 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DHX9Q08211 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DHX9Q08211 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DHX9Q08211 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DHX9Q08211 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DHX9Q08211 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DHX9Q08211 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DHX9Q08211 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DHX9Q08211 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DHX9Q08211 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DHX9Q08211 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DHX9Q08211 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DHX9Q08211 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DHX9Q08211 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DHX9Q08211 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DHX9Q08211 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DHX9Q08211 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DHX9Q08211 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.02■■□□□ 1.43
DHX9Q08211 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DHX9Q08211 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DHX9Q08211 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DHX9Q08211 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DHX9Q08211 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DHX9Q08211 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DHX9Q08211 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DHX9Q08211 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DHX9Q08211 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DHX9Q08211 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DHX9Q08211 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DHX9Q08211 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DHX9Q08211 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DHX9Q08211 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DHX9Q08211 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DHX9Q08211 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
DHX9Q08211 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DHX9Q08211 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DHX9Q08211 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DHX9Q08211 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DHX9Q08211 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DHX9Q08211 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DHX9Q08211 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DHX9Q08211 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DHX9Q08211 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DHX9Q08211 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms