Protein–RNA interactions for Protein: Q08050

FOXM1, Forkhead box protein M1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXM1Q08050 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXM1Q08050 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXM1Q08050 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXM1Q08050 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXM1Q08050 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXM1Q08050 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXM1Q08050 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXM1Q08050 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXM1Q08050 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXM1Q08050 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXM1Q08050 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXM1Q08050 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXM1Q08050 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXM1Q08050 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXM1Q08050 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXM1Q08050 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXM1Q08050 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXM1Q08050 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXM1Q08050 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXM1Q08050 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXM1Q08050 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXM1Q08050 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FOXM1Q08050 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FOXM1Q08050 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FOXM1Q08050 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FOXM1Q08050 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FOXM1Q08050 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXM1Q08050 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXM1Q08050 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXM1Q08050 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXM1Q08050 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXM1Q08050 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXM1Q08050 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXM1Q08050 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXM1Q08050 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXM1Q08050 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXM1Q08050 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXM1Q08050 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXM1Q08050 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXM1Q08050 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXM1Q08050 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXM1Q08050 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXM1Q08050 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXM1Q08050 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXM1Q08050 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXM1Q08050 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXM1Q08050 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXM1Q08050 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXM1Q08050 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXM1Q08050 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXM1Q08050 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXM1Q08050 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXM1Q08050 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXM1Q08050 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXM1Q08050 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXM1Q08050 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXM1Q08050 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXM1Q08050 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXM1Q08050 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXM1Q08050 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXM1Q08050 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXM1Q08050 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXM1Q08050 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXM1Q08050 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXM1Q08050 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXM1Q08050 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXM1Q08050 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXM1Q08050 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXM1Q08050 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXM1Q08050 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXM1Q08050 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXM1Q08050 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXM1Q08050 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXM1Q08050 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXM1Q08050 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXM1Q08050 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXM1Q08050 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXM1Q08050 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXM1Q08050 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXM1Q08050 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXM1Q08050 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXM1Q08050 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXM1Q08050 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXM1Q08050 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXM1Q08050 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXM1Q08050 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOXM1Q08050 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOXM1Q08050 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOXM1Q08050 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOXM1Q08050 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOXM1Q08050 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FOXM1Q08050 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FOXM1Q08050 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXM1Q08050 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXM1Q08050 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXM1Q08050 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXM1Q08050 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXM1Q08050 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXM1Q08050 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXM1Q08050 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms