Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
EGR3Q06889 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EGR3Q06889 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EGR3Q06889 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EGR3Q06889 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EGR3Q06889 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EGR3Q06889 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EGR3Q06889 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EGR3Q06889 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EGR3Q06889 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EGR3Q06889 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EGR3Q06889 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EGR3Q06889 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EGR3Q06889 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EGR3Q06889 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EGR3Q06889 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EGR3Q06889 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
EGR3Q06889 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EGR3Q06889 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EGR3Q06889 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EGR3Q06889 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EGR3Q06889 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EGR3Q06889 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EGR3Q06889 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EGR3Q06889 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EGR3Q06889 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EGR3Q06889 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EGR3Q06889 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EGR3Q06889 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
EGR3Q06889 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EGR3Q06889 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EGR3Q06889 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EGR3Q06889 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
EGR3Q06889 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EGR3Q06889 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EGR3Q06889 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EGR3Q06889 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EGR3Q06889 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EGR3Q06889 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EGR3Q06889 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EGR3Q06889 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EGR3Q06889 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EGR3Q06889 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EGR3Q06889 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EGR3Q06889 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EGR3Q06889 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EGR3Q06889 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EGR3Q06889 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EGR3Q06889 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EGR3Q06889 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EGR3Q06889 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EGR3Q06889 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EGR3Q06889 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EGR3Q06889 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EGR3Q06889 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EGR3Q06889 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EGR3Q06889 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EGR3Q06889 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EGR3Q06889 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EGR3Q06889 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EGR3Q06889 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EGR3Q06889 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EGR3Q06889 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EGR3Q06889 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EGR3Q06889 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EGR3Q06889 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EGR3Q06889 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EGR3Q06889 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EGR3Q06889 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EGR3Q06889 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EGR3Q06889 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EGR3Q06889 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EGR3Q06889 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EGR3Q06889 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
EGR3Q06889 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EGR3Q06889 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EGR3Q06889 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EGR3Q06889 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EGR3Q06889 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EGR3Q06889 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
EGR3Q06889 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EGR3Q06889 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EGR3Q06889 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EGR3Q06889 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
EGR3Q06889 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EGR3Q06889 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EGR3Q06889 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EGR3Q06889 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EGR3Q06889 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EGR3Q06889 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EGR3Q06889 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
EGR3Q06889 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EGR3Q06889 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EGR3Q06889 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EGR3Q06889 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EGR3Q06889 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EGR3Q06889 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EGR3Q06889 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EGR3Q06889 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EGR3Q06889 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms