Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FMODQ06828 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FMODQ06828 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FMODQ06828 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FMODQ06828 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FMODQ06828 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FMODQ06828 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FMODQ06828 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FMODQ06828 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
FMODQ06828 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FMODQ06828 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FMODQ06828 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
FMODQ06828 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FMODQ06828 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FMODQ06828 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
FMODQ06828 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FMODQ06828 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FMODQ06828 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FMODQ06828 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FMODQ06828 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FMODQ06828 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FMODQ06828 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FMODQ06828 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FMODQ06828 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FMODQ06828 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FMODQ06828 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FMODQ06828 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FMODQ06828 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FMODQ06828 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FMODQ06828 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FMODQ06828 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FMODQ06828 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
FMODQ06828 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FMODQ06828 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FMODQ06828 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FMODQ06828 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FMODQ06828 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FMODQ06828 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FMODQ06828 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
FMODQ06828 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
FMODQ06828 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FMODQ06828 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FMODQ06828 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FMODQ06828 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FMODQ06828 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FMODQ06828 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FMODQ06828 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FMODQ06828 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FMODQ06828 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FMODQ06828 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FMODQ06828 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FMODQ06828 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FMODQ06828 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FMODQ06828 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FMODQ06828 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FMODQ06828 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FMODQ06828 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FMODQ06828 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FMODQ06828 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FMODQ06828 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FMODQ06828 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FMODQ06828 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FMODQ06828 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FMODQ06828 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
FMODQ06828 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FMODQ06828 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FMODQ06828 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FMODQ06828 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FMODQ06828 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FMODQ06828 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FMODQ06828 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FMODQ06828 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FMODQ06828 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FMODQ06828 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FMODQ06828 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FMODQ06828 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FMODQ06828 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FMODQ06828 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FMODQ06828 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FMODQ06828 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FMODQ06828 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FMODQ06828 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FMODQ06828 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FMODQ06828 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FMODQ06828 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FMODQ06828 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FMODQ06828 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
FMODQ06828 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FMODQ06828 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FMODQ06828 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FMODQ06828 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FMODQ06828 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
FMODQ06828 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
FMODQ06828 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
FMODQ06828 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
FMODQ06828 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FMODQ06828 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FMODQ06828 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
FMODQ06828 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FMODQ06828 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms