Protein–RNA interactions for Protein: Q06587

RING1, E3 ubiquitin-protein ligase RING1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RING1Q06587 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RING1Q06587 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RING1Q06587 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RING1Q06587 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RING1Q06587 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RING1Q06587 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RING1Q06587 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RING1Q06587 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RING1Q06587 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RING1Q06587 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RING1Q06587 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RING1Q06587 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RING1Q06587 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RING1Q06587 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RING1Q06587 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RING1Q06587 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RING1Q06587 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RING1Q06587 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RING1Q06587 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RING1Q06587 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RING1Q06587 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RING1Q06587 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RING1Q06587 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RING1Q06587 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RING1Q06587 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RING1Q06587 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RING1Q06587 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RING1Q06587 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RING1Q06587 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RING1Q06587 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RING1Q06587 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RING1Q06587 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RING1Q06587 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RING1Q06587 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RING1Q06587 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RING1Q06587 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RING1Q06587 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RING1Q06587 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RING1Q06587 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RING1Q06587 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RING1Q06587 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RING1Q06587 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RING1Q06587 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RING1Q06587 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RING1Q06587 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RING1Q06587 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RING1Q06587 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RING1Q06587 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RING1Q06587 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RING1Q06587 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RING1Q06587 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RING1Q06587 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RING1Q06587 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RING1Q06587 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RING1Q06587 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RING1Q06587 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RING1Q06587 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RING1Q06587 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RING1Q06587 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RING1Q06587 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RING1Q06587 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RING1Q06587 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RING1Q06587 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RING1Q06587 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RING1Q06587 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RING1Q06587 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RING1Q06587 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RING1Q06587 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RING1Q06587 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RING1Q06587 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RING1Q06587 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RING1Q06587 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RING1Q06587 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RING1Q06587 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RING1Q06587 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RING1Q06587 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RING1Q06587 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RING1Q06587 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RING1Q06587 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RING1Q06587 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RING1Q06587 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RING1Q06587 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RING1Q06587 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RING1Q06587 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RING1Q06587 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RING1Q06587 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RING1Q06587 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RING1Q06587 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RING1Q06587 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RING1Q06587 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RING1Q06587 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RING1Q06587 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RING1Q06587 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RING1Q06587 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RING1Q06587 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RING1Q06587 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RING1Q06587 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RING1Q06587 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RING1Q06587 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RING1Q06587 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms