Protein–RNA interactions for Protein: Q05048

CSTF1, Cleavage stimulation factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF1Q05048 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSTF1Q05048 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CSTF1Q05048 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSTF1Q05048 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSTF1Q05048 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSTF1Q05048 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CSTF1Q05048 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSTF1Q05048 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CSTF1Q05048 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSTF1Q05048 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CSTF1Q05048 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSTF1Q05048 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CSTF1Q05048 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSTF1Q05048 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSTF1Q05048 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSTF1Q05048 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSTF1Q05048 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSTF1Q05048 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSTF1Q05048 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSTF1Q05048 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSTF1Q05048 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSTF1Q05048 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSTF1Q05048 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSTF1Q05048 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSTF1Q05048 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSTF1Q05048 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSTF1Q05048 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSTF1Q05048 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSTF1Q05048 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSTF1Q05048 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSTF1Q05048 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSTF1Q05048 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSTF1Q05048 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSTF1Q05048 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSTF1Q05048 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSTF1Q05048 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSTF1Q05048 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CSTF1Q05048 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSTF1Q05048 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSTF1Q05048 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSTF1Q05048 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSTF1Q05048 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSTF1Q05048 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSTF1Q05048 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CSTF1Q05048 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CSTF1Q05048 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSTF1Q05048 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSTF1Q05048 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSTF1Q05048 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSTF1Q05048 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSTF1Q05048 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSTF1Q05048 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSTF1Q05048 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSTF1Q05048 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CSTF1Q05048 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSTF1Q05048 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSTF1Q05048 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSTF1Q05048 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSTF1Q05048 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSTF1Q05048 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CSTF1Q05048 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSTF1Q05048 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSTF1Q05048 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSTF1Q05048 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSTF1Q05048 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSTF1Q05048 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSTF1Q05048 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSTF1Q05048 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSTF1Q05048 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSTF1Q05048 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSTF1Q05048 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSTF1Q05048 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSTF1Q05048 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSTF1Q05048 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSTF1Q05048 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CSTF1Q05048 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSTF1Q05048 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSTF1Q05048 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSTF1Q05048 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSTF1Q05048 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSTF1Q05048 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSTF1Q05048 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSTF1Q05048 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSTF1Q05048 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSTF1Q05048 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSTF1Q05048 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSTF1Q05048 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CSTF1Q05048 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSTF1Q05048 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSTF1Q05048 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSTF1Q05048 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSTF1Q05048 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CSTF1Q05048 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSTF1Q05048 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSTF1Q05048 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSTF1Q05048 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CSTF1Q05048 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSTF1Q05048 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSTF1Q05048 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSTF1Q05048 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms