Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
ATP7AQ04656 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
ATP7AQ04656 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
ATP7AQ04656 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
ATP7AQ04656 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
ATP7AQ04656 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
ATP7AQ04656 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
ATP7AQ04656 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
ATP7AQ04656 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
ATP7AQ04656 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
ATP7AQ04656 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
ATP7AQ04656 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
ATP7AQ04656 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
ATP7AQ04656 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
ATP7AQ04656 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
ATP7AQ04656 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
ATP7AQ04656 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
ATP7AQ04656 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
ATP7AQ04656 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
ATP7AQ04656 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
ATP7AQ04656 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
ATP7AQ04656 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
ATP7AQ04656 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
ATP7AQ04656 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
ATP7AQ04656 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC35.26■■■■□ 3.23
ATP7AQ04656 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC35.26■■■■□ 3.23
ATP7AQ04656 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
ATP7AQ04656 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
ATP7AQ04656 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
ATP7AQ04656 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
ATP7AQ04656 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
ATP7AQ04656 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
ATP7AQ04656 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
ATP7AQ04656 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
ATP7AQ04656 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
ATP7AQ04656 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
ATP7AQ04656 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
ATP7AQ04656 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
ATP7AQ04656 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
ATP7AQ04656 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
ATP7AQ04656 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
ATP7AQ04656 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
ATP7AQ04656 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
ATP7AQ04656 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
ATP7AQ04656 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
ATP7AQ04656 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
ATP7AQ04656 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
ATP7AQ04656 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
ATP7AQ04656 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
ATP7AQ04656 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
ATP7AQ04656 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
ATP7AQ04656 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
ATP7AQ04656 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
ATP7AQ04656 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
ATP7AQ04656 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
ATP7AQ04656 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
ATP7AQ04656 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
ATP7AQ04656 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
ATP7AQ04656 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
ATP7AQ04656 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
ATP7AQ04656 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
ATP7AQ04656 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
ATP7AQ04656 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
ATP7AQ04656 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
ATP7AQ04656 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
ATP7AQ04656 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
ATP7AQ04656 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
ATP7AQ04656 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
ATP7AQ04656 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
ATP7AQ04656 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
ATP7AQ04656 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
ATP7AQ04656 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
ATP7AQ04656 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
ATP7AQ04656 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
ATP7AQ04656 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
ATP7AQ04656 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
ATP7AQ04656 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
ATP7AQ04656 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
ATP7AQ04656 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
ATP7AQ04656 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
ATP7AQ04656 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
ATP7AQ04656 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
ATP7AQ04656 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
ATP7AQ04656 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
ATP7AQ04656 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
ATP7AQ04656 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
ATP7AQ04656 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
ATP7AQ04656 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
ATP7AQ04656 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
ATP7AQ04656 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
ATP7AQ04656 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
ATP7AQ04656 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
ATP7AQ04656 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC35.11■■■■□ 3.21
ATP7AQ04656 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
ATP7AQ04656 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
ATP7AQ04656 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
ATP7AQ04656 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
ATP7AQ04656 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
ATP7AQ04656 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
ATP7AQ04656 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms