Protein–RNA interactions for Protein: Q03721

KCNC4, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC4Q03721 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNC4Q03721 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNC4Q03721 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNC4Q03721 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNC4Q03721 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNC4Q03721 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNC4Q03721 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNC4Q03721 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNC4Q03721 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNC4Q03721 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNC4Q03721 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNC4Q03721 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNC4Q03721 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNC4Q03721 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNC4Q03721 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNC4Q03721 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNC4Q03721 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNC4Q03721 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNC4Q03721 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNC4Q03721 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNC4Q03721 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KCNC4Q03721 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNC4Q03721 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNC4Q03721 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNC4Q03721 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNC4Q03721 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNC4Q03721 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNC4Q03721 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNC4Q03721 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNC4Q03721 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNC4Q03721 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNC4Q03721 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNC4Q03721 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNC4Q03721 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNC4Q03721 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNC4Q03721 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNC4Q03721 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNC4Q03721 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNC4Q03721 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNC4Q03721 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNC4Q03721 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNC4Q03721 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNC4Q03721 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNC4Q03721 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNC4Q03721 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNC4Q03721 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNC4Q03721 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNC4Q03721 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNC4Q03721 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNC4Q03721 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNC4Q03721 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNC4Q03721 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNC4Q03721 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNC4Q03721 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNC4Q03721 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNC4Q03721 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNC4Q03721 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNC4Q03721 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNC4Q03721 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNC4Q03721 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNC4Q03721 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNC4Q03721 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNC4Q03721 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNC4Q03721 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNC4Q03721 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNC4Q03721 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNC4Q03721 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNC4Q03721 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNC4Q03721 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNC4Q03721 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNC4Q03721 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNC4Q03721 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNC4Q03721 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNC4Q03721 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCNC4Q03721 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCNC4Q03721 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCNC4Q03721 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNC4Q03721 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNC4Q03721 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNC4Q03721 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNC4Q03721 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNC4Q03721 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNC4Q03721 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNC4Q03721 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNC4Q03721 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNC4Q03721 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNC4Q03721 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNC4Q03721 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNC4Q03721 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNC4Q03721 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNC4Q03721 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNC4Q03721 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNC4Q03721 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNC4Q03721 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNC4Q03721 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNC4Q03721 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNC4Q03721 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNC4Q03721 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNC4Q03721 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNC4Q03721 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 283.2 ms