Protein–RNA interactions for Protein: Q03395

ROM1, Rod outer segment membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROM1Q03395 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ROM1Q03395 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ROM1Q03395 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ROM1Q03395 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ROM1Q03395 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ROM1Q03395 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ROM1Q03395 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ROM1Q03395 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ROM1Q03395 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ROM1Q03395 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ROM1Q03395 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ROM1Q03395 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ROM1Q03395 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ROM1Q03395 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ROM1Q03395 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ROM1Q03395 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ROM1Q03395 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ROM1Q03395 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ROM1Q03395 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ROM1Q03395 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ROM1Q03395 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ROM1Q03395 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ROM1Q03395 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ROM1Q03395 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ROM1Q03395 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ROM1Q03395 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ROM1Q03395 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ROM1Q03395 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ROM1Q03395 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ROM1Q03395 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ROM1Q03395 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ROM1Q03395 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ROM1Q03395 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ROM1Q03395 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ROM1Q03395 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ROM1Q03395 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ROM1Q03395 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ROM1Q03395 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ROM1Q03395 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ROM1Q03395 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ROM1Q03395 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ROM1Q03395 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ROM1Q03395 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ROM1Q03395 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ROM1Q03395 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ROM1Q03395 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ROM1Q03395 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ROM1Q03395 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ROM1Q03395 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ROM1Q03395 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ROM1Q03395 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ROM1Q03395 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ROM1Q03395 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ROM1Q03395 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ROM1Q03395 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ROM1Q03395 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ROM1Q03395 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ROM1Q03395 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ROM1Q03395 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ROM1Q03395 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ROM1Q03395 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ROM1Q03395 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ROM1Q03395 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ROM1Q03395 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ROM1Q03395 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ROM1Q03395 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ROM1Q03395 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ROM1Q03395 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ROM1Q03395 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ROM1Q03395 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ROM1Q03395 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ROM1Q03395 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ROM1Q03395 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ROM1Q03395 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ROM1Q03395 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
ROM1Q03395 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ROM1Q03395 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ROM1Q03395 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ROM1Q03395 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ROM1Q03395 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ROM1Q03395 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ROM1Q03395 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ROM1Q03395 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ROM1Q03395 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ROM1Q03395 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ROM1Q03395 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ROM1Q03395 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ROM1Q03395 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ROM1Q03395 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ROM1Q03395 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ROM1Q03395 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ROM1Q03395 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ROM1Q03395 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ROM1Q03395 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ROM1Q03395 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ROM1Q03395 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ROM1Q03395 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ROM1Q03395 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ROM1Q03395 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ROM1Q03395 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.8 ms