Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPCQ03188 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CENPCQ03188 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CENPCQ03188 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CENPCQ03188 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CENPCQ03188 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CENPCQ03188 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CENPCQ03188 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CENPCQ03188 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CENPCQ03188 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CENPCQ03188 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CENPCQ03188 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CENPCQ03188 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPCQ03188 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPCQ03188 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPCQ03188 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPCQ03188 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPCQ03188 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPCQ03188 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPCQ03188 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPCQ03188 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPCQ03188 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPCQ03188 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPCQ03188 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPCQ03188 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPCQ03188 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPCQ03188 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPCQ03188 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPCQ03188 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPCQ03188 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPCQ03188 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPCQ03188 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPCQ03188 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPCQ03188 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPCQ03188 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPCQ03188 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPCQ03188 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPCQ03188 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPCQ03188 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPCQ03188 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPCQ03188 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPCQ03188 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPCQ03188 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPCQ03188 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPCQ03188 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPCQ03188 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPCQ03188 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPCQ03188 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPCQ03188 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPCQ03188 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPCQ03188 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPCQ03188 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPCQ03188 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPCQ03188 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPCQ03188 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPCQ03188 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPCQ03188 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPCQ03188 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPCQ03188 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPCQ03188 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPCQ03188 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPCQ03188 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPCQ03188 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPCQ03188 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPCQ03188 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPCQ03188 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPCQ03188 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPCQ03188 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPCQ03188 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPCQ03188 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPCQ03188 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPCQ03188 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPCQ03188 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPCQ03188 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPCQ03188 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPCQ03188 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CENPCQ03188 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CENPCQ03188 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CENPCQ03188 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CENPCQ03188 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CENPCQ03188 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CENPCQ03188 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CENPCQ03188 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPCQ03188 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPCQ03188 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPCQ03188 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPCQ03188 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPCQ03188 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPCQ03188 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPCQ03188 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPCQ03188 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CENPCQ03188 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CENPCQ03188 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CENPCQ03188 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CENPCQ03188 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CENPCQ03188 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CENPCQ03188 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CENPCQ03188 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CENPCQ03188 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CENPCQ03188 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms