Protein–RNA interactions for Protein: Q03169

TNFAIP2, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP2Q03169 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNFAIP2Q03169 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TNFAIP2Q03169 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNFAIP2Q03169 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNFAIP2Q03169 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TNFAIP2Q03169 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TNFAIP2Q03169 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNFAIP2Q03169 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNFAIP2Q03169 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNFAIP2Q03169 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNFAIP2Q03169 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNFAIP2Q03169 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNFAIP2Q03169 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TNFAIP2Q03169 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNFAIP2Q03169 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNFAIP2Q03169 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNFAIP2Q03169 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNFAIP2Q03169 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNFAIP2Q03169 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TNFAIP2Q03169 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNFAIP2Q03169 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNFAIP2Q03169 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNFAIP2Q03169 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TNFAIP2Q03169 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNFAIP2Q03169 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNFAIP2Q03169 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNFAIP2Q03169 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNFAIP2Q03169 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNFAIP2Q03169 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNFAIP2Q03169 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNFAIP2Q03169 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNFAIP2Q03169 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNFAIP2Q03169 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNFAIP2Q03169 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNFAIP2Q03169 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNFAIP2Q03169 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNFAIP2Q03169 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNFAIP2Q03169 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNFAIP2Q03169 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNFAIP2Q03169 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNFAIP2Q03169 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
TNFAIP2Q03169 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNFAIP2Q03169 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNFAIP2Q03169 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNFAIP2Q03169 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNFAIP2Q03169 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNFAIP2Q03169 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNFAIP2Q03169 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNFAIP2Q03169 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNFAIP2Q03169 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNFAIP2Q03169 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNFAIP2Q03169 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNFAIP2Q03169 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNFAIP2Q03169 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TNFAIP2Q03169 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNFAIP2Q03169 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNFAIP2Q03169 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNFAIP2Q03169 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNFAIP2Q03169 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNFAIP2Q03169 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNFAIP2Q03169 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNFAIP2Q03169 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNFAIP2Q03169 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNFAIP2Q03169 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNFAIP2Q03169 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNFAIP2Q03169 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNFAIP2Q03169 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNFAIP2Q03169 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TNFAIP2Q03169 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNFAIP2Q03169 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNFAIP2Q03169 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNFAIP2Q03169 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNFAIP2Q03169 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNFAIP2Q03169 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNFAIP2Q03169 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNFAIP2Q03169 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNFAIP2Q03169 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TNFAIP2Q03169 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNFAIP2Q03169 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNFAIP2Q03169 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNFAIP2Q03169 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNFAIP2Q03169 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNFAIP2Q03169 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNFAIP2Q03169 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNFAIP2Q03169 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNFAIP2Q03169 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNFAIP2Q03169 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNFAIP2Q03169 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNFAIP2Q03169 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNFAIP2Q03169 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNFAIP2Q03169 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNFAIP2Q03169 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNFAIP2Q03169 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNFAIP2Q03169 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNFAIP2Q03169 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNFAIP2Q03169 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNFAIP2Q03169 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNFAIP2Q03169 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNFAIP2Q03169 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNFAIP2Q03169 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms