Protein–RNA interactions for Protein: Q03167

TGFBR3, Transforming growth factor beta receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR3Q03167 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TGFBR3Q03167 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TGFBR3Q03167 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TGFBR3Q03167 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TGFBR3Q03167 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TGFBR3Q03167 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TGFBR3Q03167 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TGFBR3Q03167 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TGFBR3Q03167 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TGFBR3Q03167 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TGFBR3Q03167 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TGFBR3Q03167 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TGFBR3Q03167 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TGFBR3Q03167 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TGFBR3Q03167 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TGFBR3Q03167 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TGFBR3Q03167 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TGFBR3Q03167 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TGFBR3Q03167 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TGFBR3Q03167 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TGFBR3Q03167 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TGFBR3Q03167 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TGFBR3Q03167 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TGFBR3Q03167 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TGFBR3Q03167 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TGFBR3Q03167 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TGFBR3Q03167 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TGFBR3Q03167 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TGFBR3Q03167 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TGFBR3Q03167 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TGFBR3Q03167 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TGFBR3Q03167 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TGFBR3Q03167 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TGFBR3Q03167 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TGFBR3Q03167 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TGFBR3Q03167 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TGFBR3Q03167 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TGFBR3Q03167 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TGFBR3Q03167 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TGFBR3Q03167 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TGFBR3Q03167 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TGFBR3Q03167 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TGFBR3Q03167 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TGFBR3Q03167 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TGFBR3Q03167 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TGFBR3Q03167 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TGFBR3Q03167 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TGFBR3Q03167 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TGFBR3Q03167 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TGFBR3Q03167 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TGFBR3Q03167 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TGFBR3Q03167 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TGFBR3Q03167 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TGFBR3Q03167 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TGFBR3Q03167 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TGFBR3Q03167 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TGFBR3Q03167 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TGFBR3Q03167 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TGFBR3Q03167 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TGFBR3Q03167 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TGFBR3Q03167 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TGFBR3Q03167 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TGFBR3Q03167 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TGFBR3Q03167 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TGFBR3Q03167 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TGFBR3Q03167 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TGFBR3Q03167 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TGFBR3Q03167 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TGFBR3Q03167 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TGFBR3Q03167 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TGFBR3Q03167 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TGFBR3Q03167 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TGFBR3Q03167 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TGFBR3Q03167 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TGFBR3Q03167 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TGFBR3Q03167 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TGFBR3Q03167 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TGFBR3Q03167 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TGFBR3Q03167 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TGFBR3Q03167 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TGFBR3Q03167 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TGFBR3Q03167 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TGFBR3Q03167 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TGFBR3Q03167 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TGFBR3Q03167 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TGFBR3Q03167 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TGFBR3Q03167 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TGFBR3Q03167 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TGFBR3Q03167 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TGFBR3Q03167 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TGFBR3Q03167 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TGFBR3Q03167 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TGFBR3Q03167 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TGFBR3Q03167 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TGFBR3Q03167 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TGFBR3Q03167 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TGFBR3Q03167 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TGFBR3Q03167 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TGFBR3Q03167 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TGFBR3Q03167 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms