Protein–RNA interactions for Protein: Q02790

FKBP4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FKBP4Q02790 HNRNPH1-236ENST00000519958 885 ntTSL 515.58■□□□□ 0.085e-8■■□□□ 14.3
FKBP4Q02790 HNRNPH1-216ENST00000510411 2105 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.035e-8■■□□□ 14.3
FKBP4Q02790 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.075e-8■■□□□ 14.3
FKBP4Q02790 HNRNPH1-239ENST00000521173 831 ntTSL 513.57□□□□□ -0.245e-8■■□□□ 14.3
FKBP4Q02790 HNRNPH1-227ENST00000515481 5564 ntTSL 27.17□□□□□ -1.265e-8■■□□□ 14.3
FKBP4Q02790 HNRNPH1-229ENST00000518548 527 ntTSL 24.88□□□□□ -1.635e-8■■□□□ 14.3
FKBP4Q02790 D2HGDH-205ENST00000432449 566 ntTSL 525.4■■□□□ 1.662e-6■■□□□ 14.3
FKBP4Q02790 D2HGDH-211ENST00000467427 555 ntTSL 325.4■■□□□ 1.662e-6■■□□□ 14.3
FKBP4Q02790 D2HGDH-213ENST00000470343 1026 ntTSL 1 (best)22.88■■□□□ 1.252e-6■■□□□ 14.3
FKBP4Q02790 AC015574.1-202ENST00000616588 456 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.991e-16■■□□□ 14.3
FKBP4Q02790 AC015574.1-204ENST00000612595 512 ntTSL 57.63□□□□□ -1.191e-16■■□□□ 14.3
FKBP4Q02790 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.353e-6■■□□□ 14.2
FKBP4Q02790 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.23e-6■■□□□ 14.2
FKBP4Q02790 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.953e-6■■□□□ 14.2
FKBP4Q02790 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.015e-8■■□□□ 14.2
FKBP4Q02790 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.745e-8■■□□□ 14.2
FKBP4Q02790 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.335e-8■■□□□ 14.2
FKBP4Q02790 RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 5751 ntTSL 220.12■□□□□ 0.813e-6■■□□□ 14.2
FKBP4Q02790 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.326e-7■■□□□ 14.1
FKBP4Q02790 SPON2-204ENST00000502483 571 ntTSL 431.8■■■□□ 2.686e-7■■□□□ 14.1
FKBP4Q02790 SPON2-220ENST00000515004 571 ntTSL 428.75■■■□□ 2.196e-7■■□□□ 14.1
FKBP4Q02790 C2orf82-208ENST00000481155 660 ntTSL 328.58■■■□□ 2.176e-7■■□□□ 14.1
FKBP4Q02790 PKNOX1-202ENST00000418336 459 ntTSL 226.51■■□□□ 1.836e-7■■□□□ 14.1
FKBP4Q02790 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.796e-7■■□□□ 14.1
FKBP4Q02790 AMDHD2-215ENST00000568263 1482 ntTSL 223.26■■□□□ 1.311e-6■■□□□ 14.1
FKBP4Q02790 NADSYN1-217ENST00000530534 844 ntTSL 223■■□□□ 1.276e-7■■□□□ 14.1
FKBP4Q02790 C2orf82-206ENST00000467665 2782 ntTSL 1 (best)21.7■■□□□ 1.066e-7■■□□□ 14.1
FKBP4Q02790 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.836e-7■■□□□ 14.1
FKBP4Q02790 PKNOX1-206ENST00000480179 1725 ntTSL 217.48■□□□□ 0.396e-7■■□□□ 14.1
FKBP4Q02790 NADSYN1-213ENST00000528509 2999 ntTSL 1 (best)16.96■□□□□ 0.316e-7■■□□□ 14.1
FKBP4Q02790 PKNOX1-201ENST00000291547 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.416e-7■■□□□ 14.1
FKBP4Q02790 PKNOX1-203ENST00000432907 5180 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.56e-7■■□□□ 14.1
FKBP4Q02790 TXN-201ENST00000374515 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.556e-7■■□□□ 14.1
FKBP4Q02790 NADSYN1-204ENST00000525200 3616 ntTSL 211.48□□□□□ -0.576e-7■■□□□ 14.1
FKBP4Q02790 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.171e-6■■□□□ 14.1
FKBP4Q02790 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.771e-12■■□□□ 14
FKBP4Q02790 VPS54-203ENST00000409558 4337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.161e-12■■□□□ 14
FKBP4Q02790 NFE2L2-205ENST00000430047 451 ntTSL 329.61■■■□□ 2.331e-7■■□□□ 14
FKBP4Q02790 NFE2L2-210ENST00000462023 521 ntTSL 220.25■□□□□ 0.831e-7■■□□□ 14
FKBP4Q02790 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.361e-7■■□□□ 14
FKBP4Q02790 NFE2L2-211ENST00000464747 2749 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.251e-7■■□□□ 14
FKBP4Q02790 NFE2L2-214ENST00000588123 814 ntTSL 511.95□□□□□ -0.51e-7■■□□□ 14
FKBP4Q02790 NFE2L2-213ENST00000586532 942 ntTSL 58.24□□□□□ -1.091e-7■■□□□ 14
FKBP4Q02790 ANKRD11-207ENST00000562816 573 ntTSL 415.24■□□□□ 0.039e-8■■□□□ 14
FKBP4Q02790 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.365e-7■■□□□ 13.9
FKBP4Q02790 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC7.92□□□□□ -1.145e-7■■□□□ 13.9
FKBP4Q02790 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.754e-6■■□□□ 13.9
FKBP4Q02790 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.949e-8■■□□□ 13.9
FKBP4Q02790 ANKRD11-204ENST00000378332 1982 ntTSL 225.5■■□□□ 1.679e-8■■□□□ 13.9
FKBP4Q02790 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.059e-8■■□□□ 13.9
FKBP4Q02790 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.019e-8■■□□□ 13.9
FKBP4Q02790 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.156e-7■■□□□ 13.9
FKBP4Q02790 EEF1D-214ENST00000526135 535 ntTSL 216.59■□□□□ 0.256e-7■■□□□ 13.9
FKBP4Q02790 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.694e-8■■□□□ 13.8
FKBP4Q02790 SLC2A4RG-203ENST00000474248 624 ntTSL 229.64■■■□□ 2.341e-6■■□□□ 13.8
FKBP4Q02790 SLC2A4RG-205ENST00000485897 518 ntTSL 528.85■■■□□ 2.211e-6■■□□□ 13.8
FKBP4Q02790 ASPSCR1-204ENST00000577733 5503 ntTSL 220.04■□□□□ 0.88e-10■■□□□ 13.8
FKBP4Q02790 PEG3-203ENST00000594389 411 ntTSL 329.44■■■□□ 2.31e-7■■□□□ 13.8
FKBP4Q02790 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.641e-7■■□□□ 13.8
FKBP4Q02790 PEG3-204ENST00000594706 583 ntTSL 324.72■■□□□ 1.551e-7■■□□□ 13.8
FKBP4Q02790 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.371e-7■■□□□ 13.8
FKBP4Q02790 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.271e-7■■□□□ 13.8
FKBP4Q02790 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.671e-7■■□□□ 13.8
FKBP4Q02790 PEG3-209ENST00000599577 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best)18.39■□□□□ 0.531e-7■■□□□ 13.8
FKBP4Q02790 PEG3-202ENST00000593695 4741 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.121e-7■■□□□ 13.8
FKBP4Q02790 PEG3-205ENST00000596261 570 ntTSL 411.3□□□□□ -0.61e-7■■□□□ 13.8
FKBP4Q02790 PEG3-201ENST00000326441 8723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.691e-7■■□□□ 13.8
FKBP4Q02790 SHANK3-202ENST00000414786 7394 ntTSL 522.04■■□□□ 1.121e-6■■□□□ 13.7
FKBP4Q02790 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.031e-6■■□□□ 13.7
FKBP4Q02790 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.651e-6■■□□□ 13.7
FKBP4Q02790 MIDN-202ENST00000586757 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 531.35■■■□□ 2.617e-6■■□□□ 13.7
FKBP4Q02790 MIDN-203ENST00000586843 416 ntTSL 226.63■■□□□ 1.857e-6■■□□□ 13.7
FKBP4Q02790 MIDN-205ENST00000591302 523 ntTSL 224.49■■□□□ 1.517e-6■■□□□ 13.7
FKBP4Q02790 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.027e-6■■□□□ 13.7
FKBP4Q02790 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.697e-6■■□□□ 13.7
FKBP4Q02790 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.478e-8■■□□□ 13.7
FKBP4Q02790 LUC7L-219ENST00000494545 725 ntTSL 529.36■■■□□ 2.298e-8■■□□□ 13.7
FKBP4Q02790 LMAN2-207ENST00000514458 616 ntTSL 527.2■■□□□ 1.948e-8■■□□□ 13.7
FKBP4Q02790 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.678e-8■■□□□ 13.7
FKBP4Q02790 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.268e-8■■□□□ 13.7
FKBP4Q02790 LMAN2-204ENST00000504071 562 ntTSL 222.74■■□□□ 1.238e-8■■□□□ 13.7
FKBP4Q02790 LUC7L-207ENST00000426094 2737 ntTSL 1 (best)22.37■■□□□ 1.178e-8■■□□□ 13.7
FKBP4Q02790 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.148e-8■■□□□ 13.7
FKBP4Q02790 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.028e-8■■□□□ 13.7
FKBP4Q02790 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.028e-8■■□□□ 13.7
FKBP4Q02790 LUC7L-206ENST00000419516 1211 ntTSL 516.62■□□□□ 0.258e-8■■□□□ 13.7
FKBP4Q02790 LUC7L-205ENST00000418978 989 ntTSL 515.71■□□□□ 0.118e-8■■□□□ 13.7
FKBP4Q02790 LUC7L-217ENST00000490762 2643 ntTSL 1 (best)15.71■□□□□ 0.118e-8■■□□□ 13.7
FKBP4Q02790 LUC7L-210ENST00000430864 695 ntTSL 514.91□□□□□ -0.028e-8■■□□□ 13.7
FKBP4Q02790 RER1-201ENST00000306256 695 ntTSL 526.92■■□□□ 1.94e-6■■□□□ 13.6
FKBP4Q02790 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.614e-6■■□□□ 13.6
FKBP4Q02790 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.14e-6■■□□□ 13.6
FKBP4Q02790 RER1-208ENST00000493207 686 ntTSL 221.1■□□□□ 0.974e-6■■□□□ 13.6
FKBP4Q02790 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.514e-6■■□□□ 13.6
FKBP4Q02790 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.424e-6■■□□□ 13.6
FKBP4Q02790 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.42e-6■■□□□ 13.6
FKBP4Q02790 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.623e-6■■□□□ 13.5
FKBP4Q02790 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.443e-6■■□□□ 13.5
FKBP4Q02790 NT5DC2-215ENST00000492555 2004 ntTSL 1 (best)21.25■□□□□ 0.993e-6■■□□□ 13.5
FKBP4Q02790 NT5DC2-212ENST00000487779 536 ntTSL 315.83■□□□□ 0.123e-6■■□□□ 13.5
Retrieved 100 of 2,944 protein–RNA pairs in 130.8 ms