Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CACNB1Q02641 AC073575.1-201ENST00000551125 596 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CACNB1Q02641 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CACNB1Q02641 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CACNB1Q02641 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CACNB1Q02641 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CACNB1Q02641 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CACNB1Q02641 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CACNB1Q02641 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CACNB1Q02641 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CACNB1Q02641 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CACNB1Q02641 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CACNB1Q02641 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CACNB1Q02641 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CACNB1Q02641 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CACNB1Q02641 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CACNB1Q02641 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CACNB1Q02641 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CACNB1Q02641 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CACNB1Q02641 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CACNB1Q02641 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CACNB1Q02641 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CACNB1Q02641 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CACNB1Q02641 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CACNB1Q02641 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CACNB1Q02641 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CACNB1Q02641 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CACNB1Q02641 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CACNB1Q02641 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CACNB1Q02641 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CACNB1Q02641 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CACNB1Q02641 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CACNB1Q02641 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CACNB1Q02641 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CACNB1Q02641 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CACNB1Q02641 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CACNB1Q02641 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CACNB1Q02641 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CACNB1Q02641 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CACNB1Q02641 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CACNB1Q02641 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CACNB1Q02641 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CACNB1Q02641 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CACNB1Q02641 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CACNB1Q02641 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CACNB1Q02641 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CACNB1Q02641 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CACNB1Q02641 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CACNB1Q02641 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CACNB1Q02641 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CACNB1Q02641 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CACNB1Q02641 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CACNB1Q02641 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CACNB1Q02641 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CACNB1Q02641 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CACNB1Q02641 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CACNB1Q02641 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CACNB1Q02641 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CACNB1Q02641 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CACNB1Q02641 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CACNB1Q02641 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CACNB1Q02641 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CACNB1Q02641 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CACNB1Q02641 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CACNB1Q02641 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CACNB1Q02641 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CACNB1Q02641 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CACNB1Q02641 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CACNB1Q02641 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CACNB1Q02641 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CACNB1Q02641 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CACNB1Q02641 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CACNB1Q02641 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CACNB1Q02641 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CACNB1Q02641 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CACNB1Q02641 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CACNB1Q02641 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CACNB1Q02641 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CACNB1Q02641 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CACNB1Q02641 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CACNB1Q02641 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CACNB1Q02641 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CACNB1Q02641 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CACNB1Q02641 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CACNB1Q02641 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CACNB1Q02641 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CACNB1Q02641 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CACNB1Q02641 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CACNB1Q02641 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CACNB1Q02641 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CACNB1Q02641 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CACNB1Q02641 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CACNB1Q02641 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CACNB1Q02641 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CACNB1Q02641 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CACNB1Q02641 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CACNB1Q02641 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CACNB1Q02641 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CACNB1Q02641 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CACNB1Q02641 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms