Protein–RNA interactions for Protein: Q02543

RPL18A, 60S ribosomal protein L18a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL18AQ02543 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPL18AQ02543 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPL18AQ02543 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPL18AQ02543 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL18AQ02543 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL18AQ02543 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL18AQ02543 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL18AQ02543 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL18AQ02543 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL18AQ02543 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL18AQ02543 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL18AQ02543 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL18AQ02543 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL18AQ02543 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL18AQ02543 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL18AQ02543 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL18AQ02543 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL18AQ02543 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL18AQ02543 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL18AQ02543 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL18AQ02543 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL18AQ02543 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL18AQ02543 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL18AQ02543 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL18AQ02543 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL18AQ02543 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL18AQ02543 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL18AQ02543 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL18AQ02543 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL18AQ02543 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL18AQ02543 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL18AQ02543 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL18AQ02543 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL18AQ02543 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL18AQ02543 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL18AQ02543 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL18AQ02543 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL18AQ02543 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL18AQ02543 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL18AQ02543 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL18AQ02543 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL18AQ02543 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL18AQ02543 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL18AQ02543 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL18AQ02543 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL18AQ02543 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL18AQ02543 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL18AQ02543 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL18AQ02543 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL18AQ02543 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL18AQ02543 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL18AQ02543 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL18AQ02543 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL18AQ02543 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL18AQ02543 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL18AQ02543 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL18AQ02543 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL18AQ02543 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL18AQ02543 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL18AQ02543 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL18AQ02543 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL18AQ02543 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL18AQ02543 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL18AQ02543 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL18AQ02543 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL18AQ02543 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL18AQ02543 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL18AQ02543 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL18AQ02543 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL18AQ02543 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL18AQ02543 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL18AQ02543 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL18AQ02543 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL18AQ02543 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL18AQ02543 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL18AQ02543 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL18AQ02543 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL18AQ02543 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL18AQ02543 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL18AQ02543 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL18AQ02543 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL18AQ02543 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL18AQ02543 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL18AQ02543 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL18AQ02543 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL18AQ02543 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms