Protein–RNA interactions for Protein: Q02505

MUC3A, Mucin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 3,323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC3AQ02505 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MUC3AQ02505 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MUC3AQ02505 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MUC3AQ02505 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MUC3AQ02505 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MUC3AQ02505 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MUC3AQ02505 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MUC3AQ02505 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MUC3AQ02505 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MUC3AQ02505 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MUC3AQ02505 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MUC3AQ02505 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MUC3AQ02505 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MUC3AQ02505 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MUC3AQ02505 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MUC3AQ02505 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MUC3AQ02505 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MUC3AQ02505 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MUC3AQ02505 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MUC3AQ02505 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MUC3AQ02505 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MUC3AQ02505 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MUC3AQ02505 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MUC3AQ02505 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MUC3AQ02505 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MUC3AQ02505 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MUC3AQ02505 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MUC3AQ02505 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MUC3AQ02505 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MUC3AQ02505 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MUC3AQ02505 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MUC3AQ02505 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MUC3AQ02505 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MUC3AQ02505 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MUC3AQ02505 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MUC3AQ02505 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MUC3AQ02505 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MUC3AQ02505 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MUC3AQ02505 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MUC3AQ02505 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MUC3AQ02505 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MUC3AQ02505 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MUC3AQ02505 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MUC3AQ02505 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MUC3AQ02505 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MUC3AQ02505 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MUC3AQ02505 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MUC3AQ02505 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MUC3AQ02505 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MUC3AQ02505 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MUC3AQ02505 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MUC3AQ02505 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MUC3AQ02505 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MUC3AQ02505 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MUC3AQ02505 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MUC3AQ02505 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MUC3AQ02505 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MUC3AQ02505 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MUC3AQ02505 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MUC3AQ02505 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MUC3AQ02505 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MUC3AQ02505 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MUC3AQ02505 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MUC3AQ02505 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MUC3AQ02505 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MUC3AQ02505 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MUC3AQ02505 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MUC3AQ02505 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MUC3AQ02505 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MUC3AQ02505 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MUC3AQ02505 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MUC3AQ02505 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MUC3AQ02505 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MUC3AQ02505 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MUC3AQ02505 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MUC3AQ02505 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MUC3AQ02505 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MUC3AQ02505 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MUC3AQ02505 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MUC3AQ02505 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MUC3AQ02505 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MUC3AQ02505 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MUC3AQ02505 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MUC3AQ02505 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MUC3AQ02505 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MUC3AQ02505 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MUC3AQ02505 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MUC3AQ02505 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MUC3AQ02505 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MUC3AQ02505 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MUC3AQ02505 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MUC3AQ02505 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MUC3AQ02505 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MUC3AQ02505 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MUC3AQ02505 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MUC3AQ02505 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MUC3AQ02505 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MUC3AQ02505 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MUC3AQ02505 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MUC3AQ02505 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms