Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
XPCQ01831 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
XPCQ01831 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
XPCQ01831 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
XPCQ01831 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
XPCQ01831 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
XPCQ01831 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
XPCQ01831 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
XPCQ01831 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
XPCQ01831 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
XPCQ01831 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
XPCQ01831 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
XPCQ01831 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
XPCQ01831 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
XPCQ01831 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
XPCQ01831 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
XPCQ01831 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
XPCQ01831 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
XPCQ01831 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
XPCQ01831 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
XPCQ01831 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
XPCQ01831 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
XPCQ01831 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
XPCQ01831 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
XPCQ01831 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
XPCQ01831 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
XPCQ01831 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
XPCQ01831 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
XPCQ01831 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
XPCQ01831 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
XPCQ01831 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
XPCQ01831 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
XPCQ01831 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
XPCQ01831 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
XPCQ01831 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
XPCQ01831 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
XPCQ01831 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
XPCQ01831 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
XPCQ01831 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC32.18■■■□□ 2.74
XPCQ01831 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
XPCQ01831 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
XPCQ01831 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
XPCQ01831 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
XPCQ01831 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
XPCQ01831 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
XPCQ01831 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
XPCQ01831 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
XPCQ01831 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
XPCQ01831 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
XPCQ01831 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
XPCQ01831 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
XPCQ01831 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
XPCQ01831 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
XPCQ01831 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
XPCQ01831 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
XPCQ01831 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
XPCQ01831 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
XPCQ01831 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
XPCQ01831 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
XPCQ01831 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
XPCQ01831 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
XPCQ01831 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
XPCQ01831 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
XPCQ01831 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
XPCQ01831 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
XPCQ01831 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
XPCQ01831 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
XPCQ01831 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
XPCQ01831 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
XPCQ01831 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
XPCQ01831 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
XPCQ01831 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
XPCQ01831 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
XPCQ01831 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
XPCQ01831 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
XPCQ01831 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
XPCQ01831 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
XPCQ01831 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
XPCQ01831 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
XPCQ01831 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
XPCQ01831 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
XPCQ01831 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
XPCQ01831 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
XPCQ01831 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
XPCQ01831 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
XPCQ01831 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
XPCQ01831 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
XPCQ01831 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
XPCQ01831 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
XPCQ01831 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
XPCQ01831 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
XPCQ01831 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
XPCQ01831 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
XPCQ01831 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
XPCQ01831 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
XPCQ01831 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
XPCQ01831 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
XPCQ01831 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
XPCQ01831 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
XPCQ01831 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms